More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1790 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2076  exodeoxyribonuclease VII large subunit  98 
 
 
400 aa  782  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0347558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1790  exodeoxyribonuclease VII large subunit  100 
 
 
400 aa  798  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00554465  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0850  exodeoxyribonuclease VII large subunit  46.06 
 
 
407 aa  366  1e-100  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0154  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.52 
 
 
407 aa  362  7e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.989275  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1753  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.55 
 
 
407 aa  349  4e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.198539 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1699  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  43.83 
 
 
423 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1904  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.06 
 
 
404 aa  338  1e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.950618  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2514  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.53 
 
 
401 aa  335  9e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1603  exodeoxyribonuclease VII large subunit  45.84 
 
 
410 aa  332  9e-90  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4032  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.2 
 
 
452 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1536  exodeoxyribonuclease VII large subunit  44.27 
 
 
401 aa  328  1e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0037923  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4200  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.34 
 
 
452 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.09756e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3922  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.34 
 
 
452 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0384993  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3933  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.34 
 
 
452 aa  326  5e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4310  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.12 
 
 
452 aa  325  6e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00178952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4253  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.12 
 
 
452 aa  325  6e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0297469  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.34 
 
 
452 aa  325  8e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.796094  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4404  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.34 
 
 
452 aa  325  8e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0732423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4290  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.12 
 
 
452 aa  325  9e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.507724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0944  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.12 
 
 
452 aa  325  9e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  hitchhiker  0.000327864 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1072  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  42.64 
 
 
398 aa  322  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.58037  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2323  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.45 
 
 
453 aa  322  6e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  2.07972e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2873  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.85 
 
 
451 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0504713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0833  exodeoxyribonuclease VII large subunit  42.03 
 
 
411 aa  316  4e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0015301  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2593  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  41.41 
 
 
400 aa  316  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0637064  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06490  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.89 
 
 
405 aa  315  8e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.32629e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0248  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.18 
 
 
448 aa  314  2e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  43.44 
 
 
407 aa  311  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  3.25061e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1126  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.62 
 
 
461 aa  310  2e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  6.45996e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3005  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.39 
 
 
462 aa  308  1e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.53 
 
 
457 aa  308  1e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  2.10085e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3218  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.97 
 
 
457 aa  306  4e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0287  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  39.2 
 
 
408 aa  305  6e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2406  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.59 
 
 
475 aa  304  1e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000113939  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02401  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.85 
 
 
456 aa  302  6e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  1.49221e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02363  hypothetical protein  34.85 
 
 
456 aa  302  6e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.42965e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1159  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.85 
 
 
456 aa  302  6e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  1.02008e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1848  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.51 
 
 
453 aa  302  8e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000692777  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1021  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.5 
 
 
406 aa  301  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00478651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2885  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.62 
 
 
456 aa  300  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.48025e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1267  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.93 
 
 
464 aa  300  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000176036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1168  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.62 
 
 
456 aa  299  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.33307e-06  normal  0.0126087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2660  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.62 
 
 
456 aa  299  6e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.87444e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1863  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.91 
 
 
398 aa  297  2e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3493  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.68 
 
 
403 aa  297  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.60487e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2877  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.62 
 
 
449 aa  298  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000174489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2768  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.62 
 
 
449 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000315473  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2730  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.09 
 
 
465 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  4.22836e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0693  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.54 
 
 
458 aa  296  6e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal  0.0687889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1915  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.7 
 
 
454 aa  295  7e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  1.69842e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2746  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.94 
 
 
449 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  6.99903e-06  normal  0.210011 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2661  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.94 
 
 
449 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  1.5005e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3173  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.37 
 
 
393 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2705  exodeoxyribonuclease VII large subunit  33.71 
 
 
449 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  9.63372e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2658  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.55 
 
 
455 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  4.23152e-09  normal  0.673985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0567  exodeoxyribonuclease VII  37.5 
 
 
405 aa  292  8e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.116318  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3597  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.76 
 
 
458 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  1.30865e-09  normal  0.463212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2900  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  36.55 
 
 
393 aa  291  2e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1216  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.52 
 
 
448 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0401789  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0315  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  38.17 
 
 
406 aa  290  4e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3734  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.08 
 
 
456 aa  288  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  3.26312e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1729  exodeoxyribonuclease VII large subunit  32.65 
 
 
451 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.038914  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1662  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.15 
 
 
402 aa  287  3e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1458  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.84 
 
 
454 aa  286  3e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3211  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.57 
 
 
450 aa  286  4e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.73866e-08  normal  0.203327 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1030  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.06 
 
 
447 aa  285  8e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000189378  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004342  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.35 
 
 
443 aa  284  2e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1776  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.62 
 
 
469 aa  284  2e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2985  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.3 
 
 
448 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.274759  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1378  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.61 
 
 
448 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3000  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.61 
 
 
448 aa  284  2e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01075  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.66 
 
 
443 aa  283  3e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1327  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.71 
 
 
414 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.180784  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3143  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.61 
 
 
448 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.246096 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1890  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.9 
 
 
446 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.01941e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1386  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  35.97 
 
 
414 aa  280  3e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1683  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.99 
 
 
458 aa  280  3e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1234  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.22 
 
 
448 aa  280  4e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.181169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1304  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.36 
 
 
448 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.566056  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1002  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.1 
 
 
454 aa  279  8e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000181465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0752  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.8 
 
 
460 aa  278  9e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.955357  normal  0.27096 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1515  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.36 
 
 
402 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1615  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.4 
 
 
445 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  1.93789e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1582  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.4 
 
 
445 aa  278  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0117148  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1034  Exodeoxyribonuclease VII  35.94 
 
 
447 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1670  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.41 
 
 
401 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.4352e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0736  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.71 
 
 
444 aa  278  1e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0279  exodeoxyribonuclease VII large subunit  34.7 
 
 
455 aa  278  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.86893  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1767  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.6 
 
 
447 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00135793  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5875  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.57 
 
 
460 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0782017  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0042  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  37.09 
 
 
396 aa  276  3e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1084  exodeoxyribonuclease VII large subunit  36.93 
 
 
445 aa  277  3e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.83026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2462  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.34 
 
 
460 aa  276  4e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000422545 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2037  exodeoxyribonuclease VII large subunit  37.72 
 
 
465 aa  276  4e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02974  exonuclease VII, large subunit  34.71 
 
 
450 aa  276  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2647  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.81 
 
 
466 aa  276  5e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4149  exodeoxyribonuclease VII, large subunit  34.86 
 
 
446 aa  276  6e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  2.7114e-06  normal  0.773576 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1233  exodeoxyribonuclease VII large subunit  35.91 
 
 
448 aa  275  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0743  exodeoxyribonuclease VII large subunit  31.8 
 
 
561 aa  275  8e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3028  exodeoxyribonuclease VII large subunit  38.7 
 
 
458 aa  275  1e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>