41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2753 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2753  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  344  3e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.105534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2439  hypothetical protein  96 
 
 		 175 aa  329  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0160  UvrB/UvrC protein  28.49 
 
 		 169 aa  85.5  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1950  UvrB/UvrC protein  29.14 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0127215  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1791  UvrB/UvrC protein  29.01 
 
 		 168 aa  80.1  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261454  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1827  UvrB/UvrC protein  30.49 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000280692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0387  UvrB/UvrC protein  31.33 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000814074  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0074  UvrB/UvrC protein  29.21 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0417571  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00850  UvrB/UvrC protein  30.54 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.038021  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0144  UvrB/UvrC protein  30.59 
 
 		 175 aa  77.8  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0833  UvrB/UvrC protein  30 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000420974  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0179  UvrB/UvrC protein  26.51 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1404  UvrB/UvrC protein  27.71 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0081  UvrB/UvrC protein  25 
 
 		 182 aa  68.2  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00231542  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0178  UvrB/UvrC protein  28.65 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0762  UvrB/UvrC protein  28.07 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0331206  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0074  UvrB/UvrC protein  28.25 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.525038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0253  UvrB/UvrC protein  27.06 
 
 		 174 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.552848 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0325  UvrB/UvrC protein  26.79 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00358864  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3463  UvrB/UvrC protein  29.31 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000125325  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2369  hypothetical protein  28.97 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000515373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2742  UvrB/UvrC protein  23.6 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0109  hypothetical protein  28.33 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000454963  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0075  nucleotide excision repair protein  26.55 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.452997  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0089  hypothetical protein  26.55 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.84577e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0076  UvrB/UvrC protein  26.55 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.247563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0079  hypothetical protein  26.55 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0078  hypothetical protein  26.55 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0792443  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0057  UvrB/UvrC protein  27.22 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00323429  normal  0.240627 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0077  UvrB/UvrC protein  26.55 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5226  hypothetical protein  27.12 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000128201  hitchhiker  4.7433e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0079  hypothetical protein  26.55 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0100  hypothetical protein  24.29 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2676  UvrB/UvrC protein  26.29 
 
 		 170 aa  51.2  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.712915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0559  hypothetical protein  26.4 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1482  UvrB/UvrC protein  28.22 
 
 		 145 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.051637  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0545  hypothetical protein  26.4 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2038  UVR domain-containing protein  23.12 
 
 		 165 aa  47.8  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1084  Uncharacterized protein with conserved CXXC pairs-like protein  25.75 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.944063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0125  uncharacterized protein with conserved CXXC pairs  24.35 
 
 		 193 aa  42  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.587234  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0163  UvrB/UvrC domain-containing protein  25.95 
 
 		 192 aa  41.6  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>