More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2682 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  100 
 
 
285 aa  572  1.0000000000000001e-162  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0898  cobalt transporter ATP-binding subunit  63.03 
 
 
286 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  58.16 
 
 
290 aa  361  7.0000000000000005e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  56.38 
 
 
281 aa  325  5e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  50.18 
 
 
283 aa  320  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  50.18 
 
 
283 aa  320  9.999999999999999e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  53.71 
 
 
280 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  53.55 
 
 
286 aa  310  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1687  ABC transporter related  53.41 
 
 
288 aa  296  3e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1418  ABC transporter related  54.26 
 
 
287 aa  291  1e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.61 
 
 
293 aa  288  6e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0171  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.92 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000671668  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  50.54 
 
 
280 aa  282  4.0000000000000003e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.57 
 
 
293 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0135  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.57 
 
 
293 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.168047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.57 
 
 
293 aa  281  6.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000645208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.57 
 
 
293 aa  281  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0875323  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  53.15 
 
 
325 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.22 
 
 
293 aa  280  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.54 
 
 
290 aa  278  9e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5165  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.88 
 
 
293 aa  277  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000192836  hitchhiker  0.000000000000102962 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0153  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.22 
 
 
293 aa  277  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1113499999999999e-42 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0141  cobalt transporter ATP-binding subunit  49.65 
 
 
291 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000352159  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.96 
 
 
293 aa  275  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000430525  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.57 
 
 
280 aa  269  4e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.57 
 
 
293 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24070  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  45.56 
 
 
305 aa  264  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.850026  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  46.67 
 
 
344 aa  262  4.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0289  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.85 
 
 
288 aa  260  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0412656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  48.73 
 
 
277 aa  258  8e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000015399  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2683  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.16 
 
 
281 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.904555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0317  ABC transporter related  42.5 
 
 
283 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000872921  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  45.71 
 
 
283 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  49.06 
 
 
272 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2428  ABC transporter related  45.04 
 
 
283 aa  247  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.105598  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0829  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  46.04 
 
 
292 aa  247  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.773526  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0319  cobalt transporter ATP-binding subunit  45.85 
 
 
288 aa  246  2e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  3.2074000000000003e-19 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl153  cobalt transporter ATP-binding subunit  47.5 
 
 
315 aa  246  3e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0667  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.83 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1011  ABC transporter related  44.93 
 
 
287 aa  242  6e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000809706  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3637  ABC transporter related  45.95 
 
 
303 aa  241  7e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000771297  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1419  ABC transporter related  46.07 
 
 
273 aa  240  2e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  47.27 
 
 
281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  45.21 
 
 
299 aa  232  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2301  putative ABC transporter  37.98 
 
 
289 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00300112  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1701  ABC transporter related  41.26 
 
 
292 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0226  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  44.87 
 
 
285 aa  230  2e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.6 
 
 
277 aa  227  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  44.37 
 
 
288 aa  227  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1802  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.76 
 
 
286 aa  225  5.0000000000000005e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.135758  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1152  ABC transporter related protein  41.06 
 
 
279 aa  224  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00740539  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.75 
 
 
277 aa  222  4e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.88 
 
 
277 aa  221  9e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0316  ABC transporter related  42.48 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0293906  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01470  ABC transporter related  46.69 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000364129  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02420  ABC transporter related  46.69 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1087  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  41.13 
 
 
288 aa  219  3.9999999999999997e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1688  ABC transporter related  41.01 
 
 
278 aa  219  5e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  44 
 
 
310 aa  218  7.999999999999999e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.02 
 
 
281 aa  215  8e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2248  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.59 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.231433  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2289  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.59 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.922871  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1948  cobalt ABC transporter ATPase  38.75 
 
 
289 aa  213  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701043  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.79 
 
 
278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.39 
 
 
285 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.89 
 
 
281 aa  210  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2429  ABC transporter related  41.73 
 
 
276 aa  209  3e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928129  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2125  ABC transporter related  41.37 
 
 
272 aa  210  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0679248  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.23 
 
 
284 aa  209  4e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.03 
 
 
285 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1063  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.69 
 
 
284 aa  209  6e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0204485  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12560  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  39.77 
 
 
283 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1086  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  40.53 
 
 
277 aa  207  2e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0225  ABC transporter related  42.96 
 
 
282 aa  206  3e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.758643 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1455  ABC transporter related  38.91 
 
 
275 aa  206  3e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000125166  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.07 
 
 
278 aa  205  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 
281 aa  202  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3888  ABC transporter related  37.79 
 
 
593 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000491175  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3550  cobalt transport ATP-binding protein  42.06 
 
 
605 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.290715  normal  0.403183 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0245  ABC transporter related  42.55 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.878335  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2302  putative ABC transporter  40 
 
 
273 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0179898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.25 
 
 
288 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  38.57 
 
 
398 aa  199  6e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24060  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  42.86 
 
 
278 aa  198  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.569983  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1880  ABC transporter related  39.63 
 
 
574 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1985  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.21 
 
 
276 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.41 
 
 
280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000421792  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf375  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.02 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  40.93 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000287993  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.41 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2151  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.15 
 
 
279 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0331117  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0702  ABC transporter related  43.88 
 
 
266 aa  196  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0584  membrane associated ATPase  37.37 
 
 
278 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0353  ABC transporter related  39.33 
 
 
628 aa  196  4.0000000000000005e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1504  ABC transporter related  42.86 
 
 
268 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1963  ABC transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 
268 aa  195  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0585  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.33 
 
 
274 aa  194  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0369  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
568 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  39.58 
 
 
282 aa  193  3e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>