19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0913 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0913  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
170 aa  332  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000548594  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1734  F0F1 ATP synthase subunit B  75.88 
 
 
169 aa  254  4e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1529  F0F1 ATP synthase subunit B  49.42 
 
 
172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11288  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0138  F0F1 ATP synthase subunit B  47.31 
 
 
170 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.815294  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0191  F0F1 ATP synthase subunit B  46.11 
 
 
170 aa  142  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.658435  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0098  F0F1 ATP synthase subunit B  46.79 
 
 
170 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0683  F0F1 ATP synthase subunit B  47.02 
 
 
171 aa  130  9e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.883671  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0511  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  45.7 
 
 
171 aa  129  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0110  F0F1 ATP synthase subunit B  47.9 
 
 
170 aa  125  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1407  F0F1 ATP synthase subunit B  36.75 
 
 
169 aa  103  9e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.969666  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2184  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.2 
 
 
193 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2216  ATP synthase F0, B subunit  29.17 
 
 
192 aa  51.6  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.207765  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  22.78 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2876  F0F1 ATP synthase subunit B  33.85 
 
 
184 aa  42.4  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1622  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  27.41 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.111839  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1759  ATP synthase F0, B subunit  26.36 
 
 
189 aa  41.2  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.483695  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  25.52 
 
 
164 aa  41.2  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  26.61 
 
 
156 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0989  ATP synthase F0, B subunit  26.74 
 
 
192 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0367033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>