More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1206 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  100 
 
 
398 aa  778  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  71.18 
 
 
400 aa  518  1e-146  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  68.43 
 
 
397 aa  517  1e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  68.67 
 
 
399 aa  502  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  67.97 
 
 
390 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  65.73 
 
 
392 aa  493  1e-138  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  65.73 
 
 
392 aa  493  1e-138  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  69.19 
 
 
401 aa  484  1e-135  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  65.74 
 
 
396 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  64.48 
 
 
394 aa  480  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  66.67 
 
 
401 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  68.23 
 
 
390 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  69.95 
 
 
390 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  64.89 
 
 
396 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  64.89 
 
 
396 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  66.75 
 
 
390 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  66.75 
 
 
390 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  68.51 
 
 
401 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  66.49 
 
 
390 aa  470  1e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  64.63 
 
 
396 aa  469  1e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  62.04 
 
 
385 aa  457  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  62.07 
 
 
393 aa  446  1e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  62.4 
 
 
382 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.32 
 
 
395 aa  424  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.09 
 
 
392 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  70.27 
 
 
188 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  70.27 
 
 
188 aa  261  1e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  65.57 
 
 
187 aa  219  9e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  65.57 
 
 
187 aa  219  9e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  32.43 
 
 
389 aa  182  1e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  33.07 
 
 
382 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  35.48 
 
 
383 aa  176  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.15 
 
 
404 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.12 
 
 
393 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.16 
 
 
386 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.78 
 
 
391 aa  167  3e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.96 
 
 
387 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  30.49 
 
 
393 aa  167  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.57 
 
 
387 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.35 
 
 
379 aa  166  9e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  29.72 
 
 
376 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  33.23 
 
 
388 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  28.82 
 
 
453 aa  153  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  32.25 
 
 
376 aa  153  6e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  27.78 
 
 
376 aa  153  6e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  29.07 
 
 
456 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  26.47 
 
 
442 aa  149  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  29.8 
 
 
444 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  28.28 
 
 
446 aa  147  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  28.85 
 
 
456 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  28.24 
 
 
454 aa  146  7e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.11 
 
 
450 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  31.09 
 
 
379 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  27.52 
 
 
408 aa  140  4e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  29.87 
 
 
450 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  28.53 
 
 
450 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  28.54 
 
 
408 aa  137  3e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  28.24 
 
 
456 aa  137  3e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  31.16 
 
 
418 aa  137  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  29.86 
 
 
428 aa  136  6e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  29.64 
 
 
443 aa  136  7e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  28.49 
 
 
428 aa  136  7e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  1.19825e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  32.03 
 
 
378 aa  134  2e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.05 
 
 
447 aa  134  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  28.16 
 
 
445 aa  133  4e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  27.88 
 
 
466 aa  132  1e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  28.95 
 
 
447 aa  131  2e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  28.17 
 
 
456 aa  131  2e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  27.74 
 
 
416 aa  131  2e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26.36 
 
 
420 aa  130  4e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  26.46 
 
 
460 aa  130  4e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  28.81 
 
 
412 aa  130  4e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.25 
 
 
352 aa  129  1e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  29.65 
 
 
417 aa  128  1e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  28.17 
 
 
463 aa  128  2e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  28.89 
 
 
412 aa  127  2e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  25.06 
 
 
463 aa  126  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  28.69 
 
 
449 aa  126  8e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  25.11 
 
 
469 aa  126  8e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  29.97 
 
 
452 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  26.08 
 
 
483 aa  123  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.65 
 
 
469 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  25.74 
 
 
443 aa  122  1e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.96 
 
 
441 aa  122  1e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.5 
 
 
441 aa  121  2e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.27 
 
 
469 aa  122  2e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  27.78 
 
 
454 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  28.16 
 
 
412 aa  120  5e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.71 
 
 
395 aa  119  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.58 
 
 
469 aa  119  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.29 
 
 
469 aa  117  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0612  chromate transporter  29.06 
 
 
409 aa  117  4e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  27.22 
 
 
425 aa  117  4e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  29.02 
 
 
408 aa  115  1e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  27.73 
 
 
388 aa  115  1e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  4.03685e-05 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2874  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.98 
 
 
391 aa  115  1e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.595567 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  29.34 
 
 
358 aa  115  1e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  27.67 
 
 
397 aa  114  2e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  26.09 
 
 
462 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0580  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  29.53 
 
 
383 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>