21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1722 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1722  hypothetical protein  100 
 
 
317 aa  659    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.257484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1915  polysaccharide pyruvyl transferase  35.65 
 
 
355 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0845  polysaccharide pyruvyl transferase  29.65 
 
 
376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355867  decreased coverage  0.00186143 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5866  polysaccharide pyruvyl transferase  28.01 
 
 
372 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0750  polysaccharide pyruvyl transferase  29.38 
 
 
353 aa  123  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.759816  decreased coverage  0.0000135712 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2905  polysaccharide pyruvyl transferase  30.68 
 
 
367 aa  121  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3217  polysaccharide pyruvyl transferase  30.07 
 
 
334 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2968  polysaccharide pyruvyl transferase  29.37 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.41225  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3172  polysaccharide pyruvyl transferase  28.12 
 
 
320 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475453  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3112  polysaccharide pyruvyl transferase  28.12 
 
 
320 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3683  polysaccharide pyruvyl transferase  29.76 
 
 
336 aa  91.3  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0870  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
339 aa  80.1  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6455  polysaccharide pyruvyl transferase  25.3 
 
 
361 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.854254  normal  0.145413 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1426  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.75 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1202  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.17 
 
 
339 aa  71.2  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.647724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0611  Exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.53 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2256  hypothetical protein  23.1 
 
 
269 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.803632  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3188  exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.54 
 
 
296 aa  49.7  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00782189  hitchhiker  0.00453447 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.75 
 
 
298 aa  47.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.019972 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48784  predicted protein  23.58 
 
 
532 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>