17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0071 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
342 aa  712    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1202  exopolysaccharide biosynthesis protein  75.15 
 
 
339 aa  538  9.999999999999999e-153  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.647724  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0870  exopolysaccharide biosynthesis protein  63.17 
 
 
339 aa  466  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1426  exopolysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3217  polysaccharide pyruvyl transferase  24.36 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5866  polysaccharide pyruvyl transferase  23.49 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1915  polysaccharide pyruvyl transferase  24.78 
 
 
355 aa  79.7  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2968  polysaccharide pyruvyl transferase  25 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.41225  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0750  polysaccharide pyruvyl transferase  24.44 
 
 
353 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.759816  decreased coverage  0.0000135712 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1722  hypothetical protein  23.61 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.257484 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2905  polysaccharide pyruvyl transferase  23.62 
 
 
367 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3172  polysaccharide pyruvyl transferase  23.02 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475453  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3112  polysaccharide pyruvyl transferase  23.02 
 
 
320 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48784  predicted protein  26.2 
 
 
532 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0845  polysaccharide pyruvyl transferase  25.29 
 
 
376 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355867  decreased coverage  0.00186143 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34576  predicted protein  25.54 
 
 
333 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.288806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3683  polysaccharide pyruvyl transferase  20.22 
 
 
336 aa  47.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>