10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0611 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0611  Exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 321 aa  659    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5866  polysaccharide pyruvyl transferase  28.75 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0845  polysaccharide pyruvyl transferase  26.33 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355867  decreased coverage  0.00186143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1722  hypothetical protein  23.53 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.257484 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2256  hypothetical protein  26.17 
 
 		 269 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.803632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.17 
 
 		 298 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.019972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2905  polysaccharide pyruvyl transferase  21.58 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2968  polysaccharide pyruvyl transferase  21.84 
 
 		 343 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.41225  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3217  polysaccharide pyruvyl transferase  22.99 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1915  polysaccharide pyruvyl transferase  21.07 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>