18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0750 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0750  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 353 aa  706    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.759816  decreased coverage  0.0000135712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3217  polysaccharide pyruvyl transferase  38.22 
 
 		 334 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2968  polysaccharide pyruvyl transferase  36.18 
 
 		 343 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.41225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3112  polysaccharide pyruvyl transferase  37.29 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3172  polysaccharide pyruvyl transferase  37.29 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3683  polysaccharide pyruvyl transferase  39.81 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2905  polysaccharide pyruvyl transferase  29.75 
 
 		 367 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128361 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6455  polysaccharide pyruvyl transferase  29 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.854254  normal  0.145413 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5866  polysaccharide pyruvyl transferase  27.52 
 
 		 372 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1915  polysaccharide pyruvyl transferase  30.86 
 
 		 355 aa  129  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0845  polysaccharide pyruvyl transferase  26.76 
 
 		 376 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355867  decreased coverage  0.00186143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1722  hypothetical protein  29.38 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.257484 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0870  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1426  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.83 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1202  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.42 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.647724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.12 
 
 		 342 aa  68.9  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48784  predicted protein  27.51 
 
 		 532 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34576  predicted protein  26.72 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.288806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>