18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3683 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3683  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 336 aa  671    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3112  polysaccharide pyruvyl transferase  39.13 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3172  polysaccharide pyruvyl transferase  39.13 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0750  polysaccharide pyruvyl transferase  39.74 
 
 		 353 aa  175  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.759816  decreased coverage  0.0000135712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3217  polysaccharide pyruvyl transferase  29.3 
 
 		 334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2968  polysaccharide pyruvyl transferase  28.66 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.41225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2905  polysaccharide pyruvyl transferase  26.84 
 
 		 367 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128361 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5866  polysaccharide pyruvyl transferase  24.86 
 
 		 372 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6455  polysaccharide pyruvyl transferase  27.08 
 
 		 361 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.854254  normal  0.145413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0845  polysaccharide pyruvyl transferase  24.11 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355867  decreased coverage  0.00186143 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1915  polysaccharide pyruvyl transferase  28.75 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1722  hypothetical protein  30.34 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.257484 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48784  predicted protein  25.7 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1426  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 347 aa  63.2  0.000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0870  exopolysaccharide biosynthesis protein  21.21 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34576  predicted protein  24.39 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.288806  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1202  exopolysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.647724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein  21.72 
 
 		 342 aa  46.6  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>