19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5866 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5866  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
372 aa  771    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0845  polysaccharide pyruvyl transferase  49.32 
 
 
376 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355867  decreased coverage  0.00186143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2905  polysaccharide pyruvyl transferase  47.11 
 
 
367 aa  346  4e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2968  polysaccharide pyruvyl transferase  29.25 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.41225  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3217  polysaccharide pyruvyl transferase  28.36 
 
 
334 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3172  polysaccharide pyruvyl transferase  27.51 
 
 
320 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475453  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3112  polysaccharide pyruvyl transferase  27.51 
 
 
320 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1722  hypothetical protein  28.01 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.257484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0750  polysaccharide pyruvyl transferase  26.55 
 
 
353 aa  131  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.759816  decreased coverage  0.0000135712 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1915  polysaccharide pyruvyl transferase  27.43 
 
 
355 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3683  polysaccharide pyruvyl transferase  24.93 
 
 
336 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6455  polysaccharide pyruvyl transferase  25.36 
 
 
361 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.854254  normal  0.145413 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0870  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
339 aa  95.9  1e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1202  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.7 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.647724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.73 
 
 
342 aa  79.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1426  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.38 
 
 
347 aa  73.9  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48784  predicted protein  24.19 
 
 
532 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0611  Exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.75 
 
 
321 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34576  predicted protein  23.28 
 
 
333 aa  59.7  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.288806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>