20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3217 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3217  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 334 aa  691    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2968  polysaccharide pyruvyl transferase  91.82 
 
 		 343 aa  636    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.41225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0750  polysaccharide pyruvyl transferase  38.22 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.759816  decreased coverage  0.0000135712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3112  polysaccharide pyruvyl transferase  35.64 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3172  polysaccharide pyruvyl transferase  35.64 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0845  polysaccharide pyruvyl transferase  30.46 
 
 		 376 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355867  decreased coverage  0.00186143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2905  polysaccharide pyruvyl transferase  30.74 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128361 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6455  polysaccharide pyruvyl transferase  30.59 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.854254  normal  0.145413 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5866  polysaccharide pyruvyl transferase  28.36 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3683  polysaccharide pyruvyl transferase  29.32 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1915  polysaccharide pyruvyl transferase  31.56 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1722  hypothetical protein  30.07 
 
 		 317 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.257484 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0870  exopolysaccharide biosynthesis protein  28.06 
 
 		 339 aa  93.6  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1426  exopolysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 347 aa  90.5  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1202  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.09 
 
 		 339 aa  89.4  9e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.647724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.9 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48784  predicted protein  24.74 
 
 		 532 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34576  predicted protein  27.05 
 
 		 333 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.288806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0611  Exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.99 
 
 		 321 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3188  exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  59.46 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00782189  hitchhiker  0.00453447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>