20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1915 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1915  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 		 355 aa  726    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1722  hypothetical protein  35.65 
 
 		 317 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.257484 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0750  polysaccharide pyruvyl transferase  30.86 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.759816  decreased coverage  0.0000135712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3217  polysaccharide pyruvyl transferase  31.56 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5866  polysaccharide pyruvyl transferase  27.43 
 
 		 372 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2905  polysaccharide pyruvyl transferase  27.84 
 
 		 367 aa  126  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000128361 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2968  polysaccharide pyruvyl transferase  30.39 
 
 		 343 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.41225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0845  polysaccharide pyruvyl transferase  29.41 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355867  decreased coverage  0.00186143 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3172  polysaccharide pyruvyl transferase  30.16 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3112  polysaccharide pyruvyl transferase  30.16 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3683  polysaccharide pyruvyl transferase  28.75 
 
 		 336 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1426  exopolysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.78 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0870  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1202  exopolysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.647724  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6455  polysaccharide pyruvyl transferase  23.57 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.854254  normal  0.145413 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48784  predicted protein  22.67 
 
 		 532 aa  52.4  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.33 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.019972 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34576  predicted protein  23.5 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.288806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0611  Exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  21.07 
 
 		 321 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.261467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>