19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3112 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3112  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
320 aa  650    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3172  polysaccharide pyruvyl transferase  100 
 
 
320 aa  650    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.475453  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3683  polysaccharide pyruvyl transferase  40.25 
 
 
336 aa  205  7e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691167  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0750  polysaccharide pyruvyl transferase  37.29 
 
 
353 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.759816  decreased coverage  0.0000135712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2968  polysaccharide pyruvyl transferase  33.89 
 
 
343 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.41225  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3217  polysaccharide pyruvyl transferase  35.64 
 
 
334 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5866  polysaccharide pyruvyl transferase  27.51 
 
 
372 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0845  polysaccharide pyruvyl transferase  28.94 
 
 
376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.355867  decreased coverage  0.00186143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2905  polysaccharide pyruvyl transferase  26.04 
 
 
367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000128361 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6455  polysaccharide pyruvyl transferase  27.27 
 
 
361 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.854254  normal  0.145413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1915  polysaccharide pyruvyl transferase  30.16 
 
 
355 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1722  hypothetical protein  28.12 
 
 
317 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.257484 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1426  exopolysaccharide biosynthesis protein  24.37 
 
 
347 aa  79.3  0.00000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0870  exopolysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48784  predicted protein  24.92 
 
 
532 aa  69.7  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1202  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.78 
 
 
339 aa  67  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.647724  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34576  predicted protein  25.56 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.288806  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0071  exopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.3 
 
 
298 aa  43.5  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.019972 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>