72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0905 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  75.52 
 
 
641 aa  970    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  72.81 
 
 
643 aa  967    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  76.03 
 
 
630 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  72.97 
 
 
640 aa  974    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  73.26 
 
 
644 aa  947    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  73.42 
 
 
638 aa  943    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  73.32 
 
 
641 aa  970    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  71.61 
 
 
644 aa  938    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  73.42 
 
 
638 aa  943    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  75.86 
 
 
638 aa  1021    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  75.52 
 
 
641 aa  970    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  71.76 
 
 
644 aa  940    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  73.42 
 
 
638 aa  943    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  76.03 
 
 
630 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  75.52 
 
 
641 aa  970    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  75.52 
 
 
650 aa  971    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  74.14 
 
 
523 aa  801    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  75.86 
 
 
638 aa  1023    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  73.26 
 
 
638 aa  924    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  73.26 
 
 
638 aa  922    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  75.44 
 
 
647 aa  968    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  76.18 
 
 
713 aa  1028    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  67.29 
 
 
660 aa  902    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  79.41 
 
 
644 aa  1058    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  73.42 
 
 
638 aa  943    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  75.86 
 
 
638 aa  1021    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  73.28 
 
 
640 aa  978    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  73.26 
 
 
644 aa  950    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  75.52 
 
 
650 aa  972    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  76.02 
 
 
638 aa  1023    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  73.26 
 
 
638 aa  921    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  73.44 
 
 
640 aa  977    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  71.29 
 
 
644 aa  942    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  75.04 
 
 
645 aa  978    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  76.8 
 
 
711 aa  1030    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  73.17 
 
 
641 aa  970    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  71.45 
 
 
644 aa  939    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  93.26 
 
 
638 aa  1226    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  100 
 
 
638 aa  1296    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  73.32 
 
 
641 aa  970    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  76.02 
 
 
640 aa  1009    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  29.48 
 
 
743 aa  223  8e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  28.92 
 
 
708 aa  210  6e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  28.18 
 
 
727 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  28.13 
 
 
729 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  27.27 
 
 
663 aa  179  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  25.8 
 
 
733 aa  146  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  24.77 
 
 
733 aa  135  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  25.66 
 
 
775 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  25.66 
 
 
722 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  25.66 
 
 
718 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  25.63 
 
 
761 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  23.58 
 
 
738 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  23.58 
 
 
738 aa  124  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  23.95 
 
 
738 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  25.21 
 
 
727 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  24.08 
 
 
738 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  23.67 
 
 
730 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  24.6 
 
 
808 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  23.23 
 
 
738 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  25.36 
 
 
722 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  25.36 
 
 
669 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  25.36 
 
 
669 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  25.36 
 
 
669 aa  114  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  23.11 
 
 
738 aa  103  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  25.27 
 
 
1259 aa  48.1  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4759  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.78 
 
 
288 aa  47  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  30 
 
 
1026 aa  45.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0358  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.67 
 
 
305 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.60058  normal  0.0997512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  36.17 
 
 
359 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  37.84 
 
 
827 aa  44.3  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  26.04 
 
 
786 aa  43.9  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>