66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0167 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0167  AbgT putative transporter  100 
 
 
520 aa  1033    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.583779  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0678  AbgT family protein  62.96 
 
 
518 aa  631  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0748  AbgT putative transporter  62.77 
 
 
518 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.534677  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0800  putative efflux pump component MtrF  54.37 
 
 
509 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01141  hypothetical protein  47.34 
 
 
519 aa  502  1e-141  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0739  putative ion transporter  46.41 
 
 
519 aa  499  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004283  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  47.05 
 
 
519 aa  498  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0389  hypothetical protein  45.36 
 
 
519 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3120  AbgT putative transporter  44.64 
 
 
520 aa  485  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3673  AbgT putative transporter  44.62 
 
 
518 aa  478  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3449  transporter  44.69 
 
 
512 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3423  transporter  44.96 
 
 
515 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.898769 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1944  AbgT putative transporter  43.27 
 
 
519 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432903  decreased coverage  0.00626673 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0160  transporter, putative  43.33 
 
 
519 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0147  AbgT putative transporter  43.5 
 
 
519 aa  451  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0146  AbgT putative transporter  42.91 
 
 
519 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0151  AbgT putative transporter  42.91 
 
 
519 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0146  AbgT putative transporter  42.66 
 
 
519 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0064  AbgT putative transporter  36.33 
 
 
518 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000877421  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1352  AbgT putative transporter  36.14 
 
 
519 aa  342  1e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000127247  normal  0.0238452 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0028  AbgT putative transporter  38.46 
 
 
512 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.790153  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0537  AbgT putative transporter  35.56 
 
 
529 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.121882  normal  0.78057 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0018  AbgT putative transporter  36.06 
 
 
511 aa  327  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2328  efflux pump component MtrF  36.68 
 
 
516 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.25696  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2198  AbgT putative transporter  37.08 
 
 
534 aa  321  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2500  AbgT putative transporter  34.39 
 
 
512 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.393167  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2550  AbgT putative transporter  34.39 
 
 
512 aa  310  4e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3654  AbgT putative transporter  33.52 
 
 
537 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0404  hypothetical protein  35.8 
 
 
534 aa  306  5.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000189157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3559  putative efflux pump component MtrF  34.03 
 
 
535 aa  306  7e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0134  AbgT putative transporter  33.97 
 
 
538 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.722786  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4058  AbgT putative transporter  33.58 
 
 
539 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000746135  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1388  putative ion transporter  34.98 
 
 
530 aa  303  5.000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.158074  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002729  multidrug efflux pump component MtrF  35.33 
 
 
528 aa  303  6.000000000000001e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.189489  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0156  AbgT putative transporter  33.97 
 
 
538 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.632237  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00653  putative p-aminobenzoyl-glutamate transport protein (AbgT family)  35.23 
 
 
525 aa  299  6e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4247  AbgT putative transporter  35.63 
 
 
540 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4381  AbgT putative transporter  35.63 
 
 
540 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4208  AbgT putative transporter  35.63 
 
 
540 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3833  AbgT putative transporter  35.36 
 
 
535 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03248  hypothetical protein  34.56 
 
 
522 aa  293  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4042  AbgT putative transporter  35.23 
 
 
535 aa  293  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3926  AbgT putative transporter  34.79 
 
 
535 aa  292  1e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4057  AbgT putative transporter  32.76 
 
 
539 aa  290  6e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.106368  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0094  AbgT putative transporter  35.41 
 
 
511 aa  286  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3988  AbgT putative transporter  33.71 
 
 
532 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.025023  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5237  AbgT putative transporter  30.43 
 
 
514 aa  281  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0518  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  32.72 
 
 
507 aa  279  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0029  AbgT putative transporter  32.8 
 
 
506 aa  278  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13432  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0400  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  32.71 
 
 
505 aa  278  3e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.703061  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2308  AbgT transporter family  32.93 
 
 
508 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01313  predicted cryptic aminobenzoyl-glutamate transporter  32.93 
 
 
508 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1983  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  32.93 
 
 
510 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.328307 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2289  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  32.93 
 
 
508 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01323  hypothetical protein  32.93 
 
 
508 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1452  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  32.93 
 
 
508 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1548  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  32.93 
 
 
508 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1786  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  32.72 
 
 
510 aa  271  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4202  putative aminobenzoyl-glutamate transporter  31.84 
 
 
508 aa  269  7e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.609868  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1508  AbgT putative transporter  30.95 
 
 
523 aa  253  8.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.693891  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21460  putative p-aminobenzoyl-glutamate transporter  30.07 
 
 
585 aa  225  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2611  AbgT putative transporter  26.85 
 
 
552 aa  182  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1579  aminobenzoyl-glutamate transport protein  32.21 
 
 
305 aa  158  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1577  putative efflux pump component MtrF  33.33 
 
 
263 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1137  short chain fatty acid transporter  30.26 
 
 
462 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.534367 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0815  hypothetical protein  32.84 
 
 
462 aa  43.9  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000488544  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>