195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3509 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3509  precorrin-8X methylmutase  100 
 
 
209 aa  417  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.400984  normal  0.540092 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2320  precorrin-8X methylmutase  70.73 
 
 
209 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1287  precorrin-8X methylmutase  66.99 
 
 
208 aa  276  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3178  precorrin-8X methylmutase  70.73 
 
 
209 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.333659  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3146  precorrin-8X methylmutase  67.62 
 
 
210 aa  274  5e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1250  precorrin-8X methylmutase  66.5 
 
 
208 aa  275  5e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0554951  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1898  precorrin-8X methylmutase  65.53 
 
 
208 aa  271  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.171358  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4823  precorrin-8X methylmutase  69.27 
 
 
208 aa  268  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.183427 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1244  precorrin-8X methylmutase  69.79 
 
 
208 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0926514  normal  0.29626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3117  precorrin-8X methylmutase  65.87 
 
 
230 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1591  precorrin-8X methylmutase  69.27 
 
 
208 aa  266  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.257981 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3266  Precorrin-8X methylmutase  72.33 
 
 
215 aa  266  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0444754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1193  precorrin-8X methylmutase  68.75 
 
 
208 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0208289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1673  precorrin-8X methylmutase  68.75 
 
 
208 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0355413  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1646  precorrin-8X methylmutase  68.75 
 
 
208 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.996028  normal  0.344579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1782  Precorrin-8X methylmutase  64.56 
 
 
208 aa  265  5e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.140584  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3144  precorrin-8X methylmutase  69.11 
 
 
212 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5593  Precorrin-8X methylmutase  67.16 
 
 
208 aa  263  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  0.278794 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1573  precorrin-8X methylmutase  68.23 
 
 
208 aa  262  3e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.377269  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3284  precorrin-8X methylmutase  69.95 
 
 
211 aa  261  6e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.174863  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2817  precorrin-8X methylmutase  65.87 
 
 
210 aa  260  8e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0605  precorrin-8X methylmutase  68.75 
 
 
208 aa  260  8.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.414575  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4876  precorrin-8X methylmutase  63.29 
 
 
208 aa  259  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5850  precorrin-8X methylmutase  66.34 
 
 
209 aa  259  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2399  precorrin-8X methylmutase  70.53 
 
 
208 aa  259  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.154427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4416  precorrin-8X methylmutase  63.29 
 
 
208 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.416711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2380  precorrin-8X methylmutase  67.79 
 
 
209 aa  258  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2212  precorrin-8X methylmutase  66.34 
 
 
209 aa  257  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2534  precorrin-8X methylmutase  66.34 
 
 
209 aa  256  1e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.474036  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2991  precorrin-8X methylmutase  67.15 
 
 
208 aa  256  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1888  precorrin-8X methylmutase  69.47 
 
 
209 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4572  precorrin-8X methylmutase  67.63 
 
 
208 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5370  precorrin-8X methylmutase  69.79 
 
 
208 aa  254  5e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.218381  normal  0.626073 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7175  precorrin-8X methylmutase  62.98 
 
 
210 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894546  normal  0.0915035 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6020  precorrin-8X methylmutase  63.94 
 
 
210 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00161417  normal  0.19604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2440  precorrin-8X methylmutase  65.64 
 
 
210 aa  250  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.341213  normal  0.0714057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0575  Precorrin-8X methylmutase  61.46 
 
 
206 aa  248  4e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.204948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2151  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  66.67 
 
 
210 aa  248  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108715  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1519  precorrin-8X methylmutase  70.15 
 
 
209 aa  248  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197163  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6217  precorrin-8X methylmutase  69.31 
 
 
209 aa  247  8e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0665101  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4884  precorrin-8X methylmutase  64.58 
 
 
208 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1469  precorrin-8X methylmutase  69.31 
 
 
209 aa  246  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4828  precorrin-8X methylmutase  64.58 
 
 
208 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.504707 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4706  precorrin-8X methylmutase  64.58 
 
 
208 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.735221 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17660  precorrin-8X methylmutase  62.38 
 
 
221 aa  244  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0262485  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4618  precorrin-8X methylmutase  64.06 
 
 
208 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.427711 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1569  precorrin-8X methylmutase  68.75 
 
 
208 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0892973 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0340  precorrin-8X methylmutase  66.83 
 
 
209 aa  241  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1520  precorrin-8X methylmutase  62.93 
 
 
219 aa  241  7e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0548658  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2112  precorrin-8X methylmutase  70.31 
 
 
208 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.937061  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1949  precorrin-8X methylmutase  70.31 
 
 
208 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0695491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1966  precorrin-8X methylmutase  70.31 
 
 
208 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.000701969  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1434  Precorrin-8X methylmutase  64.39 
 
 
210 aa  240  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.656935  normal  0.667092 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1162  precorrin-8X methylmutase  70.31 
 
 
208 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00824413  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1437  precorrin-8X methylmutase  63.9 
 
 
210 aa  239  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.226548  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1603  precorrin-8X methylmutase  70.31 
 
 
208 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0559116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0265  precorrin-8X methylmutase  70.31 
 
 
208 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.187916  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0895  precorrin-8X methylmutase  70.31 
 
 
208 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.182747  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2480  Precorrin-8X methylmutase  65.8 
 
 
208 aa  237  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182678  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0317  precorrin-8X methylmutase  60 
 
 
224 aa  237  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1712  Precorrin-8X methylmutase  62.93 
 
 
210 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61701  hitchhiker  0.00790463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2929  precorrin-8X methylmutase  59.71 
 
 
209 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.451647  hitchhiker  0.00280569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26500  precorrin-8X methylmutase  66.67 
 
 
208 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00589849  normal  0.995121 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2893  precorrin-8X methylmutase  56.67 
 
 
220 aa  230  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2249  precorrin-8X methylmutase  65.7 
 
 
208 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.668584  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2191  Precorrin-8X methylmutase  64.42 
 
 
211 aa  229  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0802  Precorrin-8X methylmutase  64.42 
 
 
217 aa  229  3e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.172339  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2493  precorrin-8X methylmutase  63.59 
 
 
213 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3430  precorrin-8X methylmutase  58.25 
 
 
208 aa  226  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193703  normal  0.583558 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1625  Precorrin-8X methylmutase  60 
 
 
221 aa  226  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.72148  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2866  precorrin-8X methylmutase  60.73 
 
 
732 aa  226  3e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1670  precorrin-8X methylmutase  57.81 
 
 
209 aa  221  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.793368  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5691  Precorrin-8X methylmutase  62.3 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194408  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2639  precorrin isomerase  59.61 
 
 
499 aa  218  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0523957  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1852  precorrin-8X methylmutase  55.21 
 
 
209 aa  216  1e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.334862  normal  0.809538 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0172  precorrin-8X methylmutase  58.85 
 
 
512 aa  215  4e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00890226  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2488  precorrin-8X methylmutase  57.97 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2533  precorrin-8X methylmutase  57.97 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.466209  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2525  precorrin-8X methylmutase  57.97 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.345603  normal  0.182328 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3105  precorrin-8X methylmutase  55.67 
 
 
208 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.575803  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0122  precorrin-8X methylmutase  56.54 
 
 
209 aa  209  3e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0152  Precorrin-8X methylmutase  56.22 
 
 
215 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12101  precorrin-8X methylmutase  55.07 
 
 
208 aa  195  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0138483  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2422  precorrin-8X methylmutase  60 
 
 
208 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.230932  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3376  precorrin-8X methylmutase  48.51 
 
 
221 aa  177  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.218633 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2555  precorrin-8X methylmutase  41.5 
 
 
207 aa  142  4e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0965  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  43.08 
 
 
213 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.519287  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0342  precorrin-8X methylmutase  44.62 
 
 
220 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.470855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1269  precorrin-8X methylmutase  42.86 
 
 
214 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0352716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0292  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.96 
 
 
213 aa  136  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.599912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1269  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  47.76 
 
 
219 aa  134  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1435  precorrin-8X methylmutase  40.1 
 
 
209 aa  134  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.170002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1241  precorrin-8X methylmutase  40.1 
 
 
209 aa  134  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.189427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0308  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  37.62 
 
 
207 aa  134  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2706  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  42.93 
 
 
207 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0197172  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1097  precorrin-8X methylmutase  42.08 
 
 
210 aa  132  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0927  Precorrin-8X methylmutase  42.27 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000290763 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1553  Precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.5 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.160219  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0480  precorrin isomerase, CbiC-like  36.82 
 
 
225 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0697  precorrin-8X methylmutase CbiC/CobH  38.97 
 
 
205 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>