22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_25810 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_25810  hypothetical protein  100 
 
 
420 aa  786    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0479  hypothetical protein  38.67 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.778166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1983  septum site determining protein  36.31 
 
 
403 aa  69.7  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5422  hypothetical protein  32.64 
 
 
365 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1383  hypothetical protein  33.6 
 
 
365 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.068723  normal  0.317281 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0517  hypothetical protein  33.46 
 
 
352 aa  60.1  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0591  septum site determining protein  42.6 
 
 
357 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35930  hypothetical protein  33.47 
 
 
364 aa  52.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.184188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5871  hypothetical protein  30.64 
 
 
369 aa  52.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000185366  normal  0.407546 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3909  hypothetical protein  39.53 
 
 
355 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  27.2 
 
 
402 aa  51.2  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4806  hypothetical protein  32.11 
 
 
353 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.723828  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5193  hypothetical protein  32.11 
 
 
353 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000272361 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4892  hypothetical protein  32.11 
 
 
353 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.131307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13690  hypothetical protein  35.77 
 
 
350 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00103627  normal  0.200408 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0213  chromosome partitioning-like ATPase  32.79 
 
 
346 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0728  hypothetical protein  31.36 
 
 
359 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0363  septum site determining protein  34.28 
 
 
348 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000346854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0053  hypothetical protein  40.5 
 
 
569 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0275  hypothetical protein  31.4 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3373  hypothetical protein  34.43 
 
 
325 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4040  hypothetical protein  36.48 
 
 
366 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.79902  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>