43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7203 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  91.85 
 
 
466 aa  850    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  100 
 
 
466 aa  942    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  84.55 
 
 
466 aa  805    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  92.27 
 
 
466 aa  855    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  84.98 
 
 
466 aa  805    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  91.85 
 
 
466 aa  850    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  62.88 
 
 
460 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  62.66 
 
 
460 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  62.88 
 
 
460 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  62.88 
 
 
460 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  56.48 
 
 
472 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  51.75 
 
 
470 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  54.41 
 
 
499 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  47.26 
 
 
452 aa  372  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  46.19 
 
 
441 aa  366  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  37.41 
 
 
469 aa  319  7e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  39.9 
 
 
468 aa  317  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  38.28 
 
 
453 aa  306  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  37.76 
 
 
458 aa  296  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  37.27 
 
 
459 aa  296  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  38.74 
 
 
432 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  37.29 
 
 
480 aa  290  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  37.65 
 
 
432 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  37.53 
 
 
456 aa  283  6.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  36.04 
 
 
519 aa  278  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  35.01 
 
 
538 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  35.28 
 
 
536 aa  275  2.0000000000000002e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  35.16 
 
 
538 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  36.9 
 
 
478 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  33.94 
 
 
538 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  33.03 
 
 
438 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  34.84 
 
 
434 aa  255  9e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  33.57 
 
 
440 aa  254  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  32.61 
 
 
578 aa  247  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  34.74 
 
 
427 aa  243  6e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  32.06 
 
 
436 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  32.06 
 
 
436 aa  236  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  31.35 
 
 
441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  31.26 
 
 
436 aa  233  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  31.65 
 
 
435 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  32.55 
 
 
437 aa  223  4e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  31.04 
 
 
435 aa  219  6e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0536  ATPase  52.5 
 
 
297 aa  43.1  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>