20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2390 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  454  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2561  lipoprotein  60.73 
 
 
220 aa  280  1e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00547331  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  56.02 
 
 
231 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  59.11 
 
 
220 aa  247  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3729  hypothetical protein  53.92 
 
 
219 aa  235  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2114  putative lipoprotein  55.88 
 
 
221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.458545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5161  hypothetical protein  57.29 
 
 
221 aa  228  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.183646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2893  lipoprotein  50.26 
 
 
222 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000297735  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  24.46 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  25.14 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1774  hypothetical protein  26.19 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  27.35 
 
 
232 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  25.43 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  20.42 
 
 
226 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  26.26 
 
 
226 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  22.38 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2721  hypothetical protein  22.75 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  22.71 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  27.03 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0985  putative lipoprotein  23.94 
 
 
229 aa  42  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>