34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2224 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  330  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  53.85 
 
 
143 aa  124  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  45.04 
 
 
144 aa  115  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.15 
 
 
178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.46 
 
 
150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  41.3 
 
 
139 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.65 
 
 
137 aa  101  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  38.17 
 
 
141 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.83 
 
 
193 aa  99.8  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.16 
 
 
152 aa  94.4  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  36.03 
 
 
135 aa  85.5  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.52 
 
 
142 aa  84  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  34.78 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  32.79 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  32.5 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 
166 aa  69.7  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  34.27 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  32.09 
 
 
148 aa  63.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.65 
 
 
149 aa  61.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  36.45 
 
 
148 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.91 
 
 
231 aa  57.8  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  36.89 
 
 
157 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  34.55 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  34.55 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  30.46 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  37.74 
 
 
141 aa  51.6  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  45.61 
 
 
130 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  25.45 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  41.54 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  32.29 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.87 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  24.55 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  29.31 
 
 
156 aa  40.8  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.96 
 
 
134 aa  40.4  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>