116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0213 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_0213  bacteriophage GP29 protein  100 
 
 
178 aa  360  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225853  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  82.56 
 
 
173 aa  297  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2000  hypothetical protein  71.26 
 
 
175 aa  241  3e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0577978  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1358  hypothetical protein  64.57 
 
 
177 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  64.94 
 
 
175 aa  224  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  60.82 
 
 
176 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  50.57 
 
 
137 aa  84.3  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  48.54 
 
 
135 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  50.56 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2104  PAAR motif-containing protein  48.84 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  47.06 
 
 
136 aa  71.2  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1531  PAAR motif-containing protein  48.84 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2330  PAAR motif-containing protein  47.67 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1928  PAAR motif-containing protein  47.67 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  47.67 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1728  PAAR motif-containing protein  47.67 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2496  PAAR motif-containing protein  47.67 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.433555  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1554  PAAR motif-containing protein  47.67 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2381  PAAR motif-containing protein  47.67 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  48.15 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1327  PAAR motif-containing protein  46.51 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.620595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0546  hypothetical protein  46.51 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0609  PAAR motif-containing protein  46.51 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364602  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  44.16 
 
 
87 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  45.33 
 
 
89 aa  63.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  47.44 
 
 
86 aa  62.4  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  43.59 
 
 
83 aa  62  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  28.41 
 
 
188 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5365  GP29  41.57 
 
 
89 aa  61.2  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.480508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  42.53 
 
 
88 aa  60.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0734  GP29  43.42 
 
 
86 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  42.7 
 
 
87 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  42.7 
 
 
87 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5197  hypothetical protein  30.06 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
87 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  40.91 
 
 
93 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3641  GP29  47.3 
 
 
83 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
87 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
87 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  40.51 
 
 
84 aa  57.8  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
87 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
87 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
87 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3806  PAAR  30.06 
 
 
165 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  41.57 
 
 
87 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  44.87 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  39.53 
 
 
86 aa  55.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  40.91 
 
 
94 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53640  hypothetical protein  29.27 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0232155  hitchhiker  0.000303708 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  43.75 
 
 
453 aa  54.7  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  39.51 
 
 
92 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  42.68 
 
 
88 aa  52.4  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  38.46 
 
 
83 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  38.46 
 
 
83 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2581  hypothetical protein  40.86 
 
 
94 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.559543  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2707  hypothetical protein  40.86 
 
 
94 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5468  GP29  39.51 
 
 
81 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159 
 
 
-
 
NC_003296  RS00394  hypothetical protein  43.04 
 
 
88 aa  51.2  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.33074  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  28.74 
 
 
194 aa  51.2  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2049  hypothetical protein  39.78 
 
 
94 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2660  hypothetical protein  39.78 
 
 
94 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.935328  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4517  PAAR repeat-containing protein  40.51 
 
 
86 aa  51.2  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5988  hypothetical protein  40.66 
 
 
94 aa  51.2  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0524925 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  41.56 
 
 
88 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05224  hypothetical protein  42.31 
 
 
88 aa  50.8  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  42.53 
 
 
88 aa  50.8  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  38.46 
 
 
83 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4102  hypothetical protein  43.18 
 
 
107 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  38.46 
 
 
87 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0051  hypothetical protein  26.83 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0341142  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2689  hypothetical protein  38.71 
 
 
94 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  37.18 
 
 
83 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  41.03 
 
 
90 aa  49.3  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  37.65 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  36.36 
 
 
93 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  37.18 
 
 
83 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  36.67 
 
 
92 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04484  hypothetical protein  26.47 
 
 
149 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  40 
 
 
89 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  41.89 
 
 
102 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  38.75 
 
 
86 aa  47.8  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  40.96 
 
 
88 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  35.37 
 
 
92 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1677  PAAR repeat-containing protein  38.2 
 
 
91 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954396  hitchhiker  0.00616072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0023  type VI secretion system Vgr family protein  44.23 
 
 
885 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4083  PAAR  37.66 
 
 
89 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  42.17 
 
 
88 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  40.96 
 
 
88 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  40.96 
 
 
88 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  40.96 
 
 
88 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  40.96 
 
 
88 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  40.96 
 
 
88 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  37.93 
 
 
87 aa  45.1  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  36.71 
 
 
85 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1929  hypothetical protein  36.46 
 
 
120 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  37.5 
 
 
101 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  37.35 
 
 
88 aa  44.7  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  37.35 
 
 
88 aa  44.7  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3750  hypothetical protein  34.67 
 
 
94 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.175621 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  33.75 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>