38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_4603 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  314  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  99.37 
 
 		 159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  96.86 
 
 		 159 aa  292  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  90.2 
 
 		 154 aa  260  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  85.91 
 
 		 149 aa  243  8e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  85.23 
 
 		 149 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  76.97 
 
 		 152 aa  207  6e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  59.26 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  59.82 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  39.32 
 
 		 563 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  41.23 
 
 		 580 aa  92.8  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  38.17 
 
 		 580 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  40.87 
 
 		 580 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  49.44 
 
 		 155 aa  85.1  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  37.37 
 
 		 563 aa  80.9  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  36.54 
 
 		 652 aa  79  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  35.04 
 
 		 576 aa  78.2  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  38.14 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  36.46 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  38.54 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  37.36 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  35.42 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  40.74 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  40.26 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  37.74 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  37.74 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  34.67 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  37.33 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  37 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  31.68 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  25.41 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  32.1 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  31.65 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  35.44 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  28.79 
 
 		 135 aa  48.9  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  25.93 
 
 		 142 aa  43.9  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  26.58 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  27.82 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>