56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3575 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_3575  peptidase M55, D-aminopeptidase  100 
 
 
275 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00281601  normal  0.133258 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4056  peptidase M55 D-aminopeptidase  97.82 
 
 
275 aa  527  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3349  peptidase M55 D-aminopeptidase  92.36 
 
 
275 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0275369  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4167  peptidase M55, D-aminopeptidase  92.73 
 
 
275 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4199  peptidase M55, D-aminopeptidase  92.73 
 
 
275 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1863  D-aminopeptidase DppA  91.64 
 
 
275 aa  514  1e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4422  peptidase M55 D-aminopeptidase  91.64 
 
 
275 aa  491  1e-138  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1353  putative dipeptide transport protein  73.45 
 
 
276 aa  398  1e-110  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0243  putative dipeptide transport protein  73.45 
 
 
276 aa  398  1e-110  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.997125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0320  peptidase  73.45 
 
 
275 aa  398  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1848  peptidase M55, D-aminopeptidase  73.45 
 
 
285 aa  399  1e-110  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1117  dipeptide transport protein, putative  74.91 
 
 
275 aa  399  1e-110  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.350409  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1763  putative dipeptide transport protein  73.45 
 
 
276 aa  398  1e-110  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0979  putative dipeptide transport protein  73.45 
 
 
275 aa  398  1e-110  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0397  putative dipeptide transport protein  73.45 
 
 
275 aa  398  1e-110  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.583711  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4221  peptidase M55 D-aminopeptidase  69.82 
 
 
275 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436913  normal  0.615325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0840  D-aminopeptidase DppA  71.12 
 
 
277 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181532  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3126  peptidase M55 D-aminopeptidase  71.12 
 
 
277 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1412  D-aminopeptidase DppA  62.91 
 
 
275 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0479815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1922  D-aminopeptidase DppA  61.59 
 
 
272 aa  324  8e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1323  peptidase M55 D-aminopeptidase  62.18 
 
 
271 aa  324  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.035577  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1257  peptidase M55 D-aminopeptidase  62.18 
 
 
271 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1384  hypothetical protein  62.18 
 
 
271 aa  318  5e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.803903  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3107  peptidase M55, D-aminopeptidase  59.5 
 
 
272 aa  317  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0135  D-aminopeptidase DppA  59.14 
 
 
272 aa  308  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.770845 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7323  hypothetical protein  57.25 
 
 
272 aa  301  9e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3007  peptidase M55 D-aminopeptidase  57.86 
 
 
273 aa  291  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1662  D-aminopeptidase DppA  59.78 
 
 
272 aa  289  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3239  peptidase M55 D-aminopeptidase  53.82 
 
 
271 aa  280  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4595  peptidase M55, D-aminopeptidase  56.43 
 
 
273 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0629  peptidase M55 D-aminopeptidase  44.57 
 
 
272 aa  206  3e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0390191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3975  peptidase M55 D-aminopeptidase  42.28 
 
 
273 aa  204  2e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0142  peptidase M55 D-aminopeptidase  41.91 
 
 
273 aa  200  2e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0164001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4402  peptidase M55 D-aminopeptidase  41.61 
 
 
273 aa  191  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4113  peptidase M55 D-aminopeptidase  40.51 
 
 
273 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.951094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2925  peptidase M55 D-aminopeptidase  39.35 
 
 
274 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0312  peptidase M55 D-aminopeptidase  39.55 
 
 
271 aa  166  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5273  D-aminopeptidase  39.15 
 
 
281 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394132  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19920  D-aminopeptidase DppA  35.42 
 
 
275 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  5.08019e-07  decreased coverage  4.87782e-05 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4322  peptidase M55 D-aminopeptidase  38.71 
 
 
280 aa  151  9e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1265  D-aminopeptidase DppA  36.5 
 
 
271 aa  148  1e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00495776  hitchhiker  2.82701e-07 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1594  peptidase M55 D-aminopeptidase  31.34 
 
 
271 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3210  peptidase M55 D-aminopeptidase  33.95 
 
 
277 aa  137  3e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5860  peptidase M55 D-aminopeptidase  40.37 
 
 
283 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0351  peptidase M55 D-aminopeptidase  33.46 
 
 
273 aa  132  8e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8120  D-aminopeptidase  41.05 
 
 
280 aa  128  1e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2747  peptidase M55 D-aminopeptidase  34.62 
 
 
282 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3467  peptidase M55 D-aminopeptidase  33.58 
 
 
275 aa  121  1e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0706  peptidase M55, D-aminopeptidase  35.31 
 
 
288 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4003  peptidase M55 D-aminopeptidase  32.76 
 
 
279 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0365991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1020  peptidase M55 D-aminopeptidase  35.94 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2851  peptidase M55 D-aminopeptidase  41.27 
 
 
284 aa  99.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0564974  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1790  peptidase M55 D-aminopeptidase  27.31 
 
 
278 aa  84.3  2e-15  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1743  peptidase M55 D-aminopeptidase  27.21 
 
 
268 aa  79.7  5e-14  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0783265  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0500  peptidase M55 D-aminopeptidase  20.87 
 
 
272 aa  75.1  1e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1929  peptidase M55, D-aminopeptidase  25 
 
 
272 aa  72.8  6e-12  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0142981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>