57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3107 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3107  peptidase M55, D-aminopeptidase  100 
 
 		 272 aa  557  1e-158  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0135  D-aminopeptidase DppA  87.5 
 
 		 272 aa  489  1e-137  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.770845 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7323  hypothetical protein  72.06 
 
 		 272 aa  414  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3007  peptidase M55 D-aminopeptidase  73.99 
 
 		 273 aa  411  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4595  peptidase M55, D-aminopeptidase  72.16 
 
 		 273 aa  401  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3239  peptidase M55 D-aminopeptidase  71.69 
 
 		 271 aa  388  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1662  D-aminopeptidase DppA  71.32 
 
 		 272 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1257  peptidase M55 D-aminopeptidase  68.01 
 
 		 271 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1323  peptidase M55 D-aminopeptidase  67.28 
 
 		 271 aa  374  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.035577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1922  D-aminopeptidase DppA  64.71 
 
 		 272 aa  364  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1384  hypothetical protein  66.54 
 
 		 271 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.803903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1412  D-aminopeptidase DppA  64 
 
 		 275 aa  352  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0479815 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0840  D-aminopeptidase DppA  61.43 
 
 		 277 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3126  peptidase M55 D-aminopeptidase  61.79 
 
 		 277 aa  324  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4221  peptidase M55 D-aminopeptidase  60.73 
 
 		 275 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436913  normal  0.615325 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3575  peptidase M55, D-aminopeptidase  59.5 
 
 		 275 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00281601  normal  0.133258 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3349  peptidase M55 D-aminopeptidase  58.42 
 
 		 275 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0275369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1863  D-aminopeptidase DppA  59.14 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4199  peptidase M55, D-aminopeptidase  58.78 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4167  peptidase M55, D-aminopeptidase  58.78 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1848  peptidase M55, D-aminopeptidase  58.7 
 
 		 285 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234321  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0979  putative dipeptide transport protein  58.7 
 
 		 275 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0186218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0320  peptidase  58.7 
 
 		 275 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1353  putative dipeptide transport protein  58.7 
 
 		 276 aa  308  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1763  putative dipeptide transport protein  58.7 
 
 		 276 aa  308  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0243  putative dipeptide transport protein  58.7 
 
 		 276 aa  308  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.997125  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0397  putative dipeptide transport protein  58.7 
 
 		 275 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.583711  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4056  peptidase M55 D-aminopeptidase  59.06 
 
 		 275 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4422  peptidase M55 D-aminopeptidase  58.42 
 
 		 275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1117  dipeptide transport protein, putative  58.27 
 
 		 275 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.350409  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0629  peptidase M55 D-aminopeptidase  45.22 
 
 		 272 aa  224  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0390191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0142  peptidase M55 D-aminopeptidase  43.33 
 
 		 273 aa  211  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0164001  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3975  peptidase M55 D-aminopeptidase  43.33 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4113  peptidase M55 D-aminopeptidase  42.07 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.951094  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4402  peptidase M55 D-aminopeptidase  40.37 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1594  peptidase M55 D-aminopeptidase  33.46 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177822  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2925  peptidase M55 D-aminopeptidase  35.9 
 
 		 274 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1265  D-aminopeptidase DppA  39.48 
 
 		 271 aa  158  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00495776  hitchhiker  0.000000282701 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2747  peptidase M55 D-aminopeptidase  32.95 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19920  D-aminopeptidase DppA  33.58 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000508019  decreased coverage  0.0000487782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5273  D-aminopeptidase  40.5 
 
 		 281 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394132  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0312  peptidase M55 D-aminopeptidase  36.21 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8120  D-aminopeptidase  39.42 
 
 		 280 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0351  peptidase M55 D-aminopeptidase  33.82 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4322  peptidase M55 D-aminopeptidase  37.07 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3210  peptidase M55 D-aminopeptidase  33.09 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5860  peptidase M55 D-aminopeptidase  38.51 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3467  peptidase M55 D-aminopeptidase  34.69 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0706  peptidase M55, D-aminopeptidase  37.54 
 
 		 288 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2851  peptidase M55 D-aminopeptidase  38.84 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0564974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1790  peptidase M55 D-aminopeptidase  30.43 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4003  peptidase M55 D-aminopeptidase  30.85 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0365991  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0500  peptidase M55 D-aminopeptidase  26.48 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1020  peptidase M55 D-aminopeptidase  36.7 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1743  peptidase M55 D-aminopeptidase  29.23 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0783265  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1929  peptidase M55, D-aminopeptidase  26.45 
 
 		 272 aa  90.5  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0142981  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0534  D-aminopeptidase-like protein  29.55 
 
 		 257 aa  43.5  0.004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>