56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4595 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4595  peptidase M55, D-aminopeptidase  100 
 
 
273 aa  561  1.0000000000000001e-159  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.694399 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3007  peptidase M55 D-aminopeptidase  90.84 
 
 
273 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0135  D-aminopeptidase DppA  72.89 
 
 
272 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.770845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3107  peptidase M55, D-aminopeptidase  72.16 
 
 
272 aa  401  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7323  hypothetical protein  66.67 
 
 
272 aa  361  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1257  peptidase M55 D-aminopeptidase  64.1 
 
 
271 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1323  peptidase M55 D-aminopeptidase  63.74 
 
 
271 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.035577  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1662  D-aminopeptidase DppA  67.77 
 
 
272 aa  351  7e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1922  D-aminopeptidase DppA  62.27 
 
 
272 aa  348  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1384  hypothetical protein  63.37 
 
 
271 aa  345  5e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.803903  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3239  peptidase M55 D-aminopeptidase  64.47 
 
 
271 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1412  D-aminopeptidase DppA  61.23 
 
 
275 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0479815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4221  peptidase M55 D-aminopeptidase  58.7 
 
 
275 aa  298  7e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436913  normal  0.615325 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0840  D-aminopeptidase DppA  56.34 
 
 
277 aa  295  5e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.181532  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1353  putative dipeptide transport protein  57.97 
 
 
276 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.272253  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1763  putative dipeptide transport protein  57.97 
 
 
276 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146935  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1848  peptidase M55, D-aminopeptidase  57.97 
 
 
285 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.234321  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0979  putative dipeptide transport protein  57.97 
 
 
275 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0186218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0243  putative dipeptide transport protein  57.97 
 
 
276 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.997125  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0397  putative dipeptide transport protein  57.97 
 
 
275 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.583711  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3126  peptidase M55 D-aminopeptidase  57.19 
 
 
277 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0320  peptidase  57.97 
 
 
275 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1117  dipeptide transport protein, putative  57.25 
 
 
275 aa  285  4e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.350409  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4422  peptidase M55 D-aminopeptidase  57.14 
 
 
275 aa  285  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235883  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1863  D-aminopeptidase DppA  57.5 
 
 
275 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.730063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3349  peptidase M55 D-aminopeptidase  56.07 
 
 
275 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0275369  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4167  peptidase M55, D-aminopeptidase  55.71 
 
 
275 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3575  peptidase M55, D-aminopeptidase  56.43 
 
 
275 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00281601  normal  0.133258 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4199  peptidase M55, D-aminopeptidase  55.71 
 
 
275 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4056  peptidase M55 D-aminopeptidase  55.6 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3975  peptidase M55 D-aminopeptidase  40.74 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4113  peptidase M55 D-aminopeptidase  41.03 
 
 
273 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.951094  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0629  peptidase M55 D-aminopeptidase  41.03 
 
 
272 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0390191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0142  peptidase M55 D-aminopeptidase  40 
 
 
273 aa  198  7e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0164001  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4402  peptidase M55 D-aminopeptidase  40 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1265  D-aminopeptidase DppA  39.7 
 
 
271 aa  161  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00495776  hitchhiker  0.000000282701 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2925  peptidase M55 D-aminopeptidase  36.86 
 
 
274 aa  158  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5273  D-aminopeptidase  37.31 
 
 
281 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394132  normal  0.226286 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2747  peptidase M55 D-aminopeptidase  30.71 
 
 
282 aa  142  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0351  peptidase M55 D-aminopeptidase  36.33 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0706  peptidase M55, D-aminopeptidase  39.47 
 
 
288 aa  136  5e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1594  peptidase M55 D-aminopeptidase  30.53 
 
 
271 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177822  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0312  peptidase M55 D-aminopeptidase  30.55 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4322  peptidase M55 D-aminopeptidase  35.34 
 
 
280 aa  128  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00711376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5860  peptidase M55 D-aminopeptidase  30.98 
 
 
283 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.358603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3210  peptidase M55 D-aminopeptidase  29.67 
 
 
277 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19920  D-aminopeptidase DppA  28.89 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000508019  decreased coverage  0.0000487782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8120  D-aminopeptidase  39.89 
 
 
280 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4003  peptidase M55 D-aminopeptidase  32.61 
 
 
279 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0365991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1020  peptidase M55 D-aminopeptidase  30.86 
 
 
279 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.580614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2851  peptidase M55 D-aminopeptidase  32.71 
 
 
284 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0564974  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3467  peptidase M55 D-aminopeptidase  29.67 
 
 
275 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1790  peptidase M55 D-aminopeptidase  26.86 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.304689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0500  peptidase M55 D-aminopeptidase  22.91 
 
 
272 aa  82.8  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1743  peptidase M55 D-aminopeptidase  26.94 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0783265  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1929  peptidase M55, D-aminopeptidase  23.74 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0142981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>