More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3973 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3973  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  237  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.249812 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3466  response regulator receiver protein  100 
 
 		 121 aa  237  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1975  response regulator receiver protein  97.52 
 
 		 121 aa  234  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4072  response regulator receiver protein  97.52 
 
 		 121 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.696475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3451  response regulator receiver protein  97.52 
 
 		 121 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.390224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4294  response regulator receiver protein  97.52 
 
 		 121 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4506  response regulator receiver protein  96.67 
 
 		 121 aa  231  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.242512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3587  response regulator receiver protein  87.5 
 
 		 121 aa  214  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.794363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3007  response regulator receiver protein  85.95 
 
 		 121 aa  212  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6982  response regulator receiver protein  85.83 
 
 		 121 aa  211  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.543891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3754  response regulator receiver protein  82.64 
 
 		 121 aa  204  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4831  response regulator receiver protein  82.64 
 
 		 121 aa  204  3e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1955  response regulator receiver protein  81.67 
 
 		 121 aa  199  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275329  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2121  response regulator receiver protein  72.5 
 
 		 121 aa  177  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.317416  normal  0.525904 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  51.72 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  52.1 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  53.28 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0725  response regulator receiver  50.82 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.537285 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1541  response regulator receiver protein  50.85 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0468  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  50.82 
 
 		 121 aa  114  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  50.82 
 
 		 121 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  51.64 
 
 		 128 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0915  chemotaxis protein CheY  50.83 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0788  response regulator receiver  50.83 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  49.14 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  45.69 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  48.36 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0259  putative two-component response regulator  45.69 
 
 		 121 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.40567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1378  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  47.54 
 
 		 121 aa  106  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2318  chemotaxis protein CheY  45.83 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  49.15 
 
 		 121 aa  105  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3207  response regulator receiver protein  44.17 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.138724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  46.67 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4317  chemotaxis receiver protein  45.83 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.257676  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2575  response regulator receiver protein  48.31 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0149684  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22620  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 124 aa  104  5e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0147  chemotaxis protein CheY  43.7 
 
 		 119 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  48.76 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3294  response regulator receiver  45.69 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2479  response regulator receiver protein  47.46 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.591075  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00411  chemotaxis protein CheY  45.76 
 
 		 121 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  48.76 
 
 		 121 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0899  response regulator receiver domain-containing protein  47.11 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0092  response regulator receiver protein  45 
 
 		 122 aa  99.8  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0167  response regulator receiver protein  47.15 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  47.06 
 
 		 120 aa  98.6  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  43.7 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  44.92 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1315  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0517324  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3265  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 122 aa  97.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571434  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  44.83 
 
 		 123 aa  97.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0114  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3494  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.313433 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0187  response regulator receiver protein  44.63 
 
 		 120 aa  97.1  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0278  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143889  normal  0.948049 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3065  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  95.9  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 120 aa  95.9  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 120 aa  94.7  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2437  chemotaxis response regulator, CheY1  39.32 
 
 		 122 aa  94.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.365798  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1155  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.22671  normal  0.144109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0566  response regulator receiver domain-containing protein  44.54 
 
 		 120 aa  94.4  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1101  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 122 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.956043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2177  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  94  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1793  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 122 aa  93.6  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 121 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  41.67 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  40.34 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2120  chemotaxis protein CheY  41.18 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  42.62 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0654  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  92  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0234  response regulator receiver protein  40 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.695764  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2094  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911812 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2219  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 742 aa  90.9  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1880  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 121 aa  90.1  9e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.578036 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0235  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1583  chemotaxis response regulator, CheY3  40.68 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00144899  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  38.52 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2111  Fis family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 740 aa  89.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  43.7 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3796  response regulator receiver protein  45.28 
 
 		 109 aa  89.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1853  response regulator receiver protein  41.8 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00571982  normal  0.853875 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4079  chemotaxis receiver protein  39.17 
 
 		 121 aa  88.6  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1095  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.344664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2842  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 126 aa  88.6  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.810937  normal  0.282987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6738  response regulator receiver, CheY1  43.7 
 
 		 121 aa  89.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.079904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1382  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.997925  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  39.67 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1456  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>