42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3637 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3637  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  293  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.983078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5491  hypothetical protein  95.3 
 
 		 149 aa  267  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.982679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2339  aconitase subunit 2  89.86 
 
 		 154 aa  254  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3763  hypothetical protein  87.92 
 
 		 159 aa  247  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.177508 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3760  hypothetical protein  86.58 
 
 		 159 aa  245  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0710107  normal  0.198691 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4603  hypothetical protein  85.91 
 
 		 159 aa  243  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4970  hypothetical protein  83.21 
 
 		 152 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1423  aconitase subunit 2  62.22 
 
 		 166 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00470678  normal  0.0794476 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2555  hypothetical protein  58.93 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000224136  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4854  hypothetical protein  40.17 
 
 		 563 aa  105  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.684084  normal  0.761618 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2143  protein of unknown function DUF521  40.83 
 
 		 580 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180277  normal  0.183216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4133  hypothetical protein  42.86 
 
 		 580 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47930  hypothetical protein  40.87 
 
 		 580 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.444415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0009  hypothetical protein  49.44 
 
 		 155 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.604454  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3862  hypothetical protein  34.62 
 
 		 563 aa  84.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08629  DUF521 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G00490)  33.9 
 
 		 576 aa  81.3  0.000000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.255951  normal  0.881341 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47407  predicted protein  33.07 
 
 		 652 aa  79.7  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0800  aconitase subunit 2  36.46 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000377463 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0506  protein of unknown function DUF126  31.78 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0718  hypothetical protein  34.02 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1457  hypothetical protein  38.95 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.219192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1309  hypothetical protein  36.46 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0648242  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0797  hypothetical protein  37.36 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0615  predicted aconitase subunit 2  37.66 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.478753  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1471  hypothetical protein  28.35 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6392  hypothetical protein  34.59 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6625  hypothetical protein  34.59 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.925457 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6223  hypothetical protein  33.83 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1041  hypothetical protein  36 
 
 		 138 aa  57  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.587371 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3212  protein of unknown function DUF126  30.3 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0854  hypothetical protein  29.25 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.104037 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1399  hypothetical protein  30.19 
 
 		 135 aa  51.2  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.903911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0208  hypothetical protein  30.68 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.920123  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1919  hypothetical protein  31.82 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0019  hypothetical protein  31.63 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0054  hypothetical protein  27.08 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0149  hypothetical protein  33.67 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.104212  normal  0.0128163 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1865  hypothetical protein  26.61 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00000298888  normal  0.822078 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1754  hypothetical protein  32.65 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0709  hypothetical protein  32.65 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0950  aconitase subunit 2  26.19 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0452  hypothetical protein  30.21 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.265076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>