27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0007 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0007  AAA ATPase  100 
 
 		 380 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3725  ATPase  24.86 
 
 		 455 aa  50.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1462  SMC domain protein  24.02 
 
 		 423 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0378  SMC domain protein  21.35 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2264  hypothetical protein  29.11 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  32.95 
 
 		 316 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0224  ATPase  22.31 
 
 		 352 aa  46.6  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0363611 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  27.45 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  38.89 
 
 		 1227 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2377  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1655  ABC transporter related  40 
 
 		 252 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.339871  normal  0.278117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2482  putative ABC transporter, ATP-binding domain  34.18 
 
 		 976 aa  45.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.169992  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2086  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.265209  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3144  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631033  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3258  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.219344  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1392  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1113  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2345  ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1473  ABC-transporter ATP binding protein  36.84 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2489  SMC domain-containing protein  20.95 
 
 		 452 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000889729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1849  SMC domain protein  22.31 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0694  excinuclease ABC subunit A  31.46 
 
 		 1004 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.641362 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  35.19 
 
 		 1226 aa  43.5  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4119  SMC domain protein  27.71 
 
 		 482 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0003  recombination protein F  45.83 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000366734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0578  hypothetical protein  44.9 
 
 		 660 aa  43.5  0.007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  30.11 
 
 		 1008 aa  42.7  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>