More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5997 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_5997  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  100 
 
 
667 aa  1347  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579337 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3558  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.88 
 
 
653 aa  339  1e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.102726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4278  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.62 
 
 
661 aa  337  4e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3631  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.98 
 
 
650 aa  320  4e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4279  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.02 
 
 
647 aa  310  6e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65940  putative oxidoreductase  34.2 
 
 
648 aa  308  2e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5721  putative oxidoreductase  33.74 
 
 
648 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3861  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.36 
 
 
651 aa  298  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2820  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.57 
 
 
650 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2869  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.42 
 
 
650 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4819  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.73 
 
 
661 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2912  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.88 
 
 
650 aa  293  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1044  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.93 
 
 
665 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4041  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.25 
 
 
680 aa  283  8e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117135  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.34 
 
 
667 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.75 
 
 
667 aa  281  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1197  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.99 
 
 
678 aa  279  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.415933  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3398  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.76 
 
 
680 aa  278  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3746  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.7 
 
 
680 aa  278  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0759587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1488  NADH:flavin oxidoreductase  31.7 
 
 
656 aa  276  6e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127844  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4001  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.64 
 
 
680 aa  276  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.504416  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.65 
 
 
671 aa  276  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3858  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.65 
 
 
646 aa  276  1e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0569722  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3855  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  30.75 
 
 
672 aa  275  3e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.720902  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7137  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.5 
 
 
654 aa  273  5e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832205  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.95 
 
 
678 aa  273  8e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309437  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.73 
 
 
686 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3717  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.52 
 
 
674 aa  272  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4887  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.27 
 
 
702 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4753  N-methylproline demethylase, putative  33.57 
 
 
678 aa  270  7e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0821533  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.49 
 
 
680 aa  270  7e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3207  hypothetical protein  32.93 
 
 
678 aa  266  6e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.519422 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.47 
 
 
678 aa  266  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3300  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.63 
 
 
687 aa  265  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789807  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1528  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.43 
 
 
681 aa  264  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.124714 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4819  NADH:-lavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.09 
 
 
687 aa  264  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3416  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.4 
 
 
678 aa  264  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623509  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1582  NADH-flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  32.92 
 
 
687 aa  263  5e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0276819  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5066  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.74 
 
 
687 aa  263  6e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671736  normal  0.0284931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.33 
 
 
686 aa  262  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.697936  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0707  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.27 
 
 
687 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0474  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.27 
 
 
687 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.368918  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1003  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.27 
 
 
687 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0831  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.27 
 
 
687 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0743  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.27 
 
 
687 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1976  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.27 
 
 
687 aa  261  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.27 
 
 
687 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889569  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5223  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.45 
 
 
686 aa  259  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493589  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4017  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  31.88 
 
 
686 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662358  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1865  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  33.09 
 
 
687 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.715282  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4782  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.12 
 
 
686 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6185  putative FMN oxidoreductase  32.18 
 
 
686 aa  258  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.114781  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2421  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.47 
 
 
668 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0058  stachydrine utilization oxidoreductase protein  32.74 
 
 
687 aa  256  1e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71260  putative FMN oxidoreductase  32 
 
 
686 aa  256  1e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1303  NADH:flavin oxidoreductase  29.54 
 
 
671 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292118  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0396  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  31.58 
 
 
686 aa  254  4e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1000  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.11 
 
 
678 aa  254  4e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3549  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.53 
 
 
687 aa  250  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.53 
 
 
687 aa  250  6e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231835  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1844  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.62 
 
 
671 aa  248  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.82 
 
 
686 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4931  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.15 
 
 
641 aa  248  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.156402  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0574  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.33 
 
 
687 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4685  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.69 
 
 
587 aa  248  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4897  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.82 
 
 
686 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616438  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.33 
 
 
687 aa  247  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467216  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2193  NADH oxidase  30.96 
 
 
637 aa  246  8e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0331  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.82 
 
 
686 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907336  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0310  oxidoreductase, FMN-binding  31.82 
 
 
686 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.019532  hitchhiker  0.00413942 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.33 
 
 
687 aa  246  1e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3286  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.33 
 
 
687 aa  246  1e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5203  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.33 
 
 
687 aa  246  1e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.23 
 
 
681 aa  243  6e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226158  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3681  putative NADH-dependent oxidase  36.34 
 
 
688 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0197334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4536  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.58 
 
 
682 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.519189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.7 
 
 
644 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.7 
 
 
677 aa  241  4e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5465  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.51 
 
 
690 aa  240  8e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663425  normal  0.914634 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0990  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.27 
 
 
694 aa  237  5e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8007  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.75 
 
 
686 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632121  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1515  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.44 
 
 
686 aa  234  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.556111  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63640  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  33.91 
 
 
681 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.771531  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.68 
 
 
654 aa  234  3e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5533  2,4-dienoyl-CoA reductase FadH2  33.53 
 
 
681 aa  231  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3142  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.97 
 
 
645 aa  230  8e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2572  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.57 
 
 
652 aa  229  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000750697  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5525  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.61 
 
 
686 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215393  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1344  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.82 
 
 
676 aa  226  9e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2663  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.9 
 
 
701 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.838271 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1452  2,4-dienoyl-CoA reductase  33.77 
 
 
681 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148373 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2254  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.75 
 
 
664 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274029  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6110  2,4-dienoyl-CoA reductase  32.7 
 
 
676 aa  223  1e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1378  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  25.93 
 
 
612 aa  222  2e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0879  2,4-dienoyl-CoA reductase  32.37 
 
 
670 aa  222  2e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667587  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.33 
 
 
688 aa  221  3e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388153  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.59 
 
 
684 aa  221  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0925  2,4-dienoyl-CoA reductase  30.64 
 
 
680 aa  220  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2951  2,4-dienoyl-CoA reductase  32.33 
 
 
677 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.140431 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.13 
 
 
671 aa  218  3e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00189686  normal  0.0287247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>