More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3681 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4913  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.45 
 
 
678 aa  895    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0309437  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4753  N-methylproline demethylase, putative  70.76 
 
 
678 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0821533  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4887  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  73.7 
 
 
702 aa  901    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3681  putative NADH-dependent oxidase  100 
 
 
688 aa  1386    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0197334  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3207  hypothetical protein  85.81 
 
 
678 aa  1014    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.519422 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1528  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  66.61 
 
 
681 aa  815    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.124714 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3137  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  64.72 
 
 
681 aa  772    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226158  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4825  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  71.11 
 
 
678 aa  890    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3416  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  98.96 
 
 
678 aa  1157    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.623509  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1197  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  78.89 
 
 
678 aa  960    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.415933  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2849  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.82 
 
 
677 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4001  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.98 
 
 
680 aa  511  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.504416  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3746  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.98 
 
 
680 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0759587 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4041  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.46 
 
 
680 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.117135  normal  0.22934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3398  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  48.01 
 
 
680 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2478  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.5 
 
 
680 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4053  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  47.01 
 
 
686 aa  488  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.697936  normal  0.250836 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8007  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.86 
 
 
686 aa  474  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.632121  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5066  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.93 
 
 
687 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.671736  normal  0.0284931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1582  NADH-flavin oxidoreductase / NADH oxidase family protein  43.95 
 
 
687 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0276819  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0474  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.95 
 
 
687 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.368918  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0831  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.95 
 
 
687 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0707  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.95 
 
 
687 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2110  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.95 
 
 
687 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.889569  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0743  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.95 
 
 
687 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309731  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1865  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  44.1 
 
 
687 aa  464  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.715282  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1976  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.95 
 
 
687 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1003  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.95 
 
 
687 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0396  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase family protein  43.32 
 
 
686 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4819  NADH:-lavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.61 
 
 
687 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5223  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  41.78 
 
 
686 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.493589  normal  0.033231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0495  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.12 
 
 
686 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2724  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.75 
 
 
688 aa  458  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.388153  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3300  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.08 
 
 
687 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789807  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4017  oxidoreductase, FAD/FMN-binding  43.42 
 
 
686 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.662358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4782  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.15 
 
 
686 aa  458  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.204736 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0990  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  44.43 
 
 
694 aa  456  1e-127  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71260  putative FMN oxidoreductase  42.81 
 
 
686 aa  457  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1000  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  46.8 
 
 
678 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0319472  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0058  stachydrine utilization oxidoreductase protein  43.59 
 
 
687 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5525  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.52 
 
 
686 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215393  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6185  putative FMN oxidoreductase  42.98 
 
 
686 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.114781  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0310  oxidoreductase, FMN-binding  42.29 
 
 
686 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.019532  hitchhiker  0.00413942 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0333  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.12 
 
 
686 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4897  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.29 
 
 
686 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.616438  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0331  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  42.29 
 
 
686 aa  444  1e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0907336  normal  0.733781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0574  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.63 
 
 
687 aa  433  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5203  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.44 
 
 
687 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3286  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.78 
 
 
687 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5082  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.78 
 
 
687 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582774  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3549  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.27 
 
 
687 aa  431  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.61 
 
 
687 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467216  normal  0.406194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4494  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.46 
 
 
687 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.231835  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4951  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  43.37 
 
 
684 aa  430  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5465  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  45.04 
 
 
690 aa  414  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.663425  normal  0.914634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4278  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.62 
 
 
661 aa  292  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3558  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.83 
 
 
653 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.102726  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3631  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.79 
 
 
650 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.453694  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1303  NADH:flavin oxidoreductase  33.63 
 
 
671 aa  247  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.292118  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5997  putative NADH-dependent flavin oxidoreductase  36.55 
 
 
667 aa  243  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00579337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1044  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34 
 
 
665 aa  242  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1488  NADH:flavin oxidoreductase  34.44 
 
 
656 aa  241  4e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127844  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1983  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.93 
 
 
667 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3973  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.69 
 
 
671 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0968  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.82 
 
 
644 aa  226  1e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.132179  normal  0.162387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1844  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  37.1 
 
 
671 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4279  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.11 
 
 
647 aa  225  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5721  putative oxidoreductase  31.48 
 
 
648 aa  223  9e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3858  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.71 
 
 
646 aa  220  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0569722  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4819  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  35.08 
 
 
661 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65940  putative oxidoreductase  30.81 
 
 
648 aa  217  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2254  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  33.22 
 
 
664 aa  216  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274029  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4685  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.64 
 
 
587 aa  214  5.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2991  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  29.71 
 
 
645 aa  213  9e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3861  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.45 
 
 
651 aa  213  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2869  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.79 
 
 
650 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2820  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.96 
 
 
650 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2421  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.24 
 
 
668 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4536  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.83 
 
 
682 aa  209  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.519189  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1019  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.74 
 
 
667 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2912  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.07 
 
 
650 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0863  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.74 
 
 
674 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2429  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  26.72 
 
 
646 aa  205  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1344  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.74 
 
 
674 aa  205  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.460987  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1323  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  32.86 
 
 
674 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6110  2,4-dienoyl-CoA reductase  36.76 
 
 
676 aa  203  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0146  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  30.26 
 
 
654 aa  200  7.999999999999999e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7137  NADH-flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.4 
 
 
654 aa  197  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.832205  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4309  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  34.03 
 
 
673 aa  196  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.467576  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0537  2,4-dienoyl-CoA reductase (NADPH)  34.11 
 
 
684 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.45506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1479  NADH:flavin oxidoreductase  27.5 
 
 
650 aa  196  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0501  2,4-dienoyl-coa reductase  32.2 
 
 
673 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2951  2,4-dienoyl-CoA reductase  31.74 
 
 
677 aa  194  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.140431 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4477  2,4-dienoyl-CoA reductase  32.39 
 
 
674 aa  194  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1595  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  36.47 
 
 
667 aa  193  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1093  2,4-dienoyl-CoA reductase  31.97 
 
 
673 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0563  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  31.97 
 
 
673 aa  192  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1515  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.97 
 
 
673 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0916177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1598  FAD/FMN-binding/pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.97 
 
 
673 aa  192  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3539  2,4-dienoyl-CoA reductase  32.62 
 
 
673 aa  192  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.599107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>