More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0153 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0153  aldo-keto reductase  100 
 
 
333 aa  679    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4273  aldo/keto reductase  70.18 
 
 
330 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3489  aldo/keto reductase  67.87 
 
 
331 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4538  aldo/keto reductase  68.37 
 
 
331 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.145809 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0794  aldo/keto reductase  62.73 
 
 
326 aa  426  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.632761  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0728  aldo/keto reductase  59.4 
 
 
333 aa  400  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3036  aldo/keto reductase  58.77 
 
 
328 aa  381  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0625383  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3444  aldo/keto reductase  58.68 
 
 
331 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0256  aldo/keto reductase  58.72 
 
 
328 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.223996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0831  aldo/keto reductase  56.59 
 
 
330 aa  379  1e-104  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0614  aldo/keto reductase  56.93 
 
 
330 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0648  aldo/keto reductase  58.02 
 
 
330 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.153576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3336  aldo/keto reductase  55.45 
 
 
331 aa  376  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31770  putative oxidoreductase  55.56 
 
 
331 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0402  aldo/keto reductase  56.85 
 
 
335 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0608954  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3322  aldo/keto reductase  57.78 
 
 
330 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4462  aldo/keto reductase  57.1 
 
 
317 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0096  aldo/keto reductase  57.69 
 
 
335 aa  373  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.69349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2512  aldo/keto reductase  55.56 
 
 
328 aa  371  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.319114 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  58.51 
 
 
449 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0447  aldo/keto reductase  55.56 
 
 
328 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.227175 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2171  aldo/keto reductase  58.15 
 
 
324 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0933  aldo/keto reductase  57.06 
 
 
327 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.673892  normal  0.749159 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0110  aldo/keto reductase  55.65 
 
 
334 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1767  aldo/keto reductase  53.29 
 
 
329 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.883175  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2886  aldo/keto reductase  55.69 
 
 
328 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253297  normal  0.167279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3134  aldo/keto reductase  58.46 
 
 
328 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1902  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.49 
 
 
329 aa  366  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00458886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4022  aldo/keto reductase  56.29 
 
 
331 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6144  aldo/keto reductase  54.19 
 
 
331 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1172  aldo/keto reductase  54.68 
 
 
331 aa  366  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0170373  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2271  aldo/keto reductase  53.89 
 
 
329 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0397783  normal  0.307626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3076  aldo/keto reductase  54.49 
 
 
329 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.545769  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2999  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.49 
 
 
329 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1958  aldo/keto reductase  56.46 
 
 
326 aa  365  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2855  aldo/keto reductase  55.08 
 
 
327 aa  364  1e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113356  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2331  aldo/keto reductase  57.01 
 
 
329 aa  363  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.196419  normal  0.2019 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4894  aldo/keto reductase  57.49 
 
 
331 aa  363  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3903  aldo/keto reductase  55.86 
 
 
327 aa  363  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.392961  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3526  aldo/keto reductase  56.42 
 
 
328 aa  363  2e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3382  aldo/keto reductase  55.62 
 
 
340 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.159588  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2791  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  55.21 
 
 
331 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.314524  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0475  aldo/keto reductase  53.64 
 
 
331 aa  362  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3235  aldo/keto reductase  58.15 
 
 
328 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2047  aldo/keto reductase  53.59 
 
 
329 aa  361  9e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.128714  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4118  aldo/keto reductase  56.8 
 
 
328 aa  361  9e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1952  aldo/keto reductase  54.79 
 
 
329 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03042  oxidoreductase  55.13 
 
 
309 aa  360  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1098  putative oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase-like  54.95 
 
 
334 aa  360  3e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2444  aldo/keto reductase  54.08 
 
 
331 aa  359  3e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.959905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32530  Aldo/keto reductase protein  55.45 
 
 
330 aa  358  5e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0329  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.24 
 
 
329 aa  358  6e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.403522 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4374  aldo/keto reductase  55.65 
 
 
334 aa  358  6e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25984  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0167  aldo/keto reductase  54.13 
 
 
335 aa  358  7e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.691429  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32500  Aldo/keto reductase protein  53.29 
 
 
329 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0635  aldo/keto reductase  56.76 
 
 
328 aa  356  2.9999999999999997e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0797  putative aldo/keto reductase  53.89 
 
 
327 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3126  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.76 
 
 
334 aa  354  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27430  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  56.8 
 
 
328 aa  354  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153572  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38040  Aldo/keto reductase  52.99 
 
 
329 aa  353  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2445  aldo/keto reductase  54.27 
 
 
327 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.587238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1012  aldo/keto reductase  55.12 
 
 
324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.613048 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0577  aldo/keto reductase  58.46 
 
 
330 aa  352  4e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2519  aldo/keto reductase  53.54 
 
 
331 aa  352  7e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.542493  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2760  aldo/keto reductase  54.29 
 
 
327 aa  351  8.999999999999999e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6241  aldo/keto reductase  52.69 
 
 
327 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0613  aldo/keto reductase  56.31 
 
 
328 aa  349  3e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0221334 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1798  aldo/keto reductase  52.13 
 
 
333 aa  349  4e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000356157  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0434  aldo/keto reductase  53.03 
 
 
334 aa  348  6e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.543204  normal  0.0329552 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0217  oxidoreductase transmembrane protein  56.59 
 
 
342 aa  348  7e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3214  aldo/keto reductase  52.54 
 
 
331 aa  347  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3528  aldo/keto reductase  54.87 
 
 
332 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0544  aldo/keto reductase  57.8 
 
 
330 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.256151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3286  aldo/keto reductase  56.75 
 
 
329 aa  346  3e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.186639  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3206  aldo/keto reductase  55.18 
 
 
325 aa  345  6e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1743  aldo/keto reductase  51.52 
 
 
334 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00138583  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6147  aldo/keto reductase  55.28 
 
 
325 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0088  aldo/keto reductase  55.14 
 
 
491 aa  344  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4963  aldo/keto reductase  55.45 
 
 
328 aa  341  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0173735  normal  0.596284 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0958  aldo/keto reductase  51.5 
 
 
331 aa  340  2e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.420577  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  50.9 
 
 
327 aa  339  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2472  aldo/keto reductase  54.05 
 
 
329 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5029  aldo/keto reductase  51.82 
 
 
330 aa  337  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2330  aldo/keto reductase  56.46 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0173  aldo/keto reductase  53.15 
 
 
328 aa  336  2.9999999999999997e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2239  aldo/keto reductase  52.01 
 
 
321 aa  335  7e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0168  aldo/keto reductase  51.5 
 
 
326 aa  335  7.999999999999999e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6616  aldo/keto reductase  53.37 
 
 
328 aa  335  9e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3627  aldo/keto reductase  54.18 
 
 
325 aa  334  1e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303826  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3242  aldo/keto reductase  51.34 
 
 
327 aa  334  1e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4719  aldo/keto reductase family oxidoreductase  52.4 
 
 
327 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3244  aldo/keto reductase  52.42 
 
 
329 aa  333  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.667963  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1949  aldo/keto reductase  53.03 
 
 
330 aa  332  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.876461  normal  0.0859376 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4260  aldo/keto reductase  51.2 
 
 
327 aa  332  5e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4205  aldo/keto reductase  55.59 
 
 
338 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0155  aldo-keto reductase yakc (NADP+)  55.26 
 
 
329 aa  330  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886712  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38050  Aldo/keto reductase  51.5 
 
 
401 aa  329  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0147  aldo-keto reductase YakC  54.95 
 
 
329 aa  328  8e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0910  aldo/keto reductase  56 
 
 
324 aa  327  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.226692  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1083  aryl-alcohol dehydrogenase  51.2 
 
 
329 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>