More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0122 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  65.14 
 
 
519 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  64.61 
 
 
519 aa  664    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  100 
 
 
508 aa  1051    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  46.09 
 
 
507 aa  439  9.999999999999999e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  43.49 
 
 
512 aa  402  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  41.88 
 
 
514 aa  392  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  33.67 
 
 
458 aa  282  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  31.18 
 
 
536 aa  239  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  31.14 
 
 
572 aa  213  7.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  30.31 
 
 
523 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  30.38 
 
 
554 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  29.45 
 
 
518 aa  207  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  30.16 
 
 
549 aa  200  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  29.52 
 
 
480 aa  192  9e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  29.24 
 
 
481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  30.07 
 
 
526 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  29.96 
 
 
494 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  30.25 
 
 
511 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  29.62 
 
 
499 aa  162  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  27.71 
 
 
473 aa  161  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  31.08 
 
 
486 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  31.04 
 
 
497 aa  160  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  27.92 
 
 
498 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  30.66 
 
 
496 aa  156  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  29.88 
 
 
480 aa  150  7e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  27.77 
 
 
482 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  28.93 
 
 
513 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  26.26 
 
 
476 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  29.25 
 
 
509 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000929958  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0587  sulfatase  27.13 
 
 
511 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  28 
 
 
512 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1130  sulfatase  27.45 
 
 
537 aa  139  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.216257  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  27.93 
 
 
497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  27.59 
 
 
517 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000191984  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  28.54 
 
 
495 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  24.43 
 
 
537 aa  137  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  26.53 
 
 
502 aa  136  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  28.26 
 
 
517 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  28.96 
 
 
511 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  27.36 
 
 
587 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  26.55 
 
 
516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  26.55 
 
 
516 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  28.48 
 
 
517 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  28.06 
 
 
520 aa  134  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  28.09 
 
 
501 aa  134  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  28.27 
 
 
517 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  28.09 
 
 
501 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  28.32 
 
 
535 aa  132  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  28.27 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6149  choline-sulfatase  26.32 
 
 
503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.989807 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5213  choline-sulfatase  26.59 
 
 
516 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  28.27 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  28.27 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  28.27 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  28.27 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  27.08 
 
 
510 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  28.06 
 
 
502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05040  arylsulfatase A family protein  24.8 
 
 
474 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  28.02 
 
 
505 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2051  sulfatase  25.96 
 
 
474 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0158429  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  26.4 
 
 
502 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  27.62 
 
 
503 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  27.53 
 
 
496 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01140  arylsulfatase A family protein  25.82 
 
 
483 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  27.98 
 
 
504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  26.53 
 
 
565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  28.03 
 
 
501 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  27.22 
 
 
518 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  26.88 
 
 
505 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  0.0000926567 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  27.33 
 
 
505 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000895462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2381  sulfatase family protein  24.9 
 
 
511 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  27.12 
 
 
501 aa  120  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  25.24 
 
 
482 aa  120  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  27.47 
 
 
478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1250  sulfatase  25.26 
 
 
489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.820666  normal  0.257041 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  25.43 
 
 
508 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  26.99 
 
 
503 aa  117  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3489  sulfatase  24.52 
 
 
535 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  26.65 
 
 
489 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  26.29 
 
 
501 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  24.74 
 
 
504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2233  sulfatase  25.37 
 
 
511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2763  sulfatase  25.42 
 
 
478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.449052  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1565  sulfatase  27.37 
 
 
453 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.717098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  27.14 
 
 
505 aa  114  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  25.95 
 
 
594 aa  113  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  27.07 
 
 
505 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  25.82 
 
 
493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  26.56 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2600  sulfatase  24.46 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  25.61 
 
 
498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  26.57 
 
 
459 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  24.85 
 
 
501 aa  110  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1251  sulfatase  24.59 
 
 
485 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.601083  normal  0.331628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2234  sulfatase  24.18 
 
 
506 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0764  sulfatase  25.42 
 
 
559 aa  109  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.726055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2434  sulfatase  23.63 
 
 
564 aa  108  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  30.56 
 
 
515 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2156  sulfatase  26.35 
 
 
487 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  26.5 
 
 
502 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>