18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2704 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2704  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  512  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00973242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2435  hypothetical protein  39.51 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0124023 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1756  hypothetical protein  32.95 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.763596 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0769  hypothetical protein  51.43 
 
 		 439 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0668153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2323  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  60.66 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.121669  hitchhiker  0.0000988538 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2503  hypothetical protein  50.68 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14680  hypothetical protein  36.55 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5836  hypothetical protein  46.51 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425484  normal  0.644094 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1254  hypothetical protein  34.46 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100866 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08680  LysM domain-containing protein  54.24 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.738223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1371  Peptidoglycan-binding LysM  50.85 
 
 		 369 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0982128  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4275  hypothetical protein  38.71 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162006  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20580  LysM domain-containing protein  47.46 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.192276  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3805  hypothetical protein  41.38 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0179227  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1820  hypothetical protein  38.71 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3686  Peptidoglycan-binding LysM  40 
 
 		 97 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0233  peptidoglycan-binding LysM  43.33 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02210  hypothetical protein  39.66 
 
 		 166 aa  43.9  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>