More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2103 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0383  FeS assembly protein SufB  72.77 
 
 
552 aa  733    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13340  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  79.41 
 
 
483 aa  803    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.891672  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2963  FeS assembly protein SufB  84.73 
 
 
470 aa  838    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5116  hypothetical protein  64.79 
 
 
465 aa  648    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3083  FeS assembly protein SufB  81.62 
 
 
476 aa  828    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00853454  normal  0.21053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4847  hypothetical protein  64.36 
 
 
465 aa  646    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4688  iron-regulated ABC transporter  64.58 
 
 
465 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5084  FeS assembly protein SufB  64.58 
 
 
465 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4703  iron-regulated ABC transporter  64.58 
 
 
465 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1140  FeS assembly protein SufB  82.79 
 
 
481 aa  818    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0592763  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5119  FeS assembly protein SufB  64.79 
 
 
465 aa  648    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  84.09 
 
 
470 aa  843    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3575  FeS assembly protein SufB  64.58 
 
 
465 aa  647    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1845  FeS assembly protein SufB  94.87 
 
 
487 aa  970    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000251387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5154  FeS assembly protein SufB  81.34 
 
 
481 aa  841    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0495  FeS assembly protein SufB  66.06 
 
 
466 aa  651    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1357  FeS assembly protein SufB  83.66 
 
 
479 aa  824    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5213  hypothetical protein  64.36 
 
 
465 aa  646    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2919  FeS assembly protein SufB  64.88 
 
 
465 aa  650    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1972  FeS assembly protein SufB  80.17 
 
 
470 aa  809    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0119  FeS assembly protein SufB  64.36 
 
 
465 aa  646    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2224  FeS assembly protein SufB  82.26 
 
 
470 aa  832    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912442  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1660  FeS assembly protein SufB  79.65 
 
 
470 aa  807    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0336452  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0407  FeS assembly protein SufB  64.92 
 
 
472 aa  639    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5121  FeS assembly protein SufB  64.64 
 
 
463 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14620  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  80.59 
 
 
475 aa  790    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0927589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2340  FeS assembly protein SufB  81.3 
 
 
479 aa  825    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3310  FeS assembly protein SufB  80.84 
 
 
476 aa  829    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000706368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5394  FeS assembly protein SufB  64.77 
 
 
477 aa  648    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.879339 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2436  FeS assembly protein SufB  78.23 
 
 
487 aa  822    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0170  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  66.16 
 
 
470 aa  662    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0990  FeS assembly protein SufB  64.47 
 
 
465 aa  648    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.582648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5987  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  81.47 
 
 
470 aa  829    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.329158  normal  0.36597 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2390  FeS assembly protein SufB  64.21 
 
 
473 aa  645    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16130  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  79.83 
 
 
482 aa  816    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.513972  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2103  FeS assembly protein SufB  100 
 
 
487 aa  1008    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.271625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2085  FeS assembly protein SufB  79.87 
 
 
470 aa  803    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3677  FeS assembly protein SufB  80.97 
 
 
479 aa  830    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.971678  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1135  FeS assembly protein SufB  79.4 
 
 
470 aa  802    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.738863  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2276  FeS assembly protein SufB  80.13 
 
 
481 aa  819    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0173083  normal  0.0964229 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2550  FeS assembly protein SufB  82.2 
 
 
472 aa  837    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2263  FeS assembly protein SufB  82.72 
 
 
470 aa  827    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.188846 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2481  FeS assembly protein SufB  78.23 
 
 
487 aa  822    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373021  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2442  FeS assembly protein SufB  81.62 
 
 
477 aa  806    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0668958  normal  0.161703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2733  FeS assembly protein SufB  80.13 
 
 
479 aa  825    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323984  normal  0.116285 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11490  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  85.1 
 
 
490 aa  874    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.640004  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3070  FeS assembly protein SufB  65.31 
 
 
465 aa  653    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2383  FeS assembly protein SufB  80.56 
 
 
485 aa  818    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.356199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1671  FeS assembly protein SufB  82.38 
 
 
485 aa  830    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.225457  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2064  FeS assembly protein SufB  80.56 
 
 
480 aa  818    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0606  Fe-S cluster assembly ABC transporter permease  67.63 
 
 
499 aa  716    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0160759  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21950  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  84.75 
 
 
482 aa  814    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.15123  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4801  FeS assembly protein SufB  64.79 
 
 
465 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2509  FeS assembly protein SufB  80.56 
 
 
485 aa  818    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2917  FeS assembly protein SufB  83.41 
 
 
478 aa  817    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1698  FeS assembly protein SufB  66.16 
 
 
469 aa  670    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2472  FeS assembly protein SufB  78.23 
 
 
487 aa  822    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.591436  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0473  FeS assembly protein SufB  62.66 
 
 
467 aa  632  1e-180  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0344639  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0712  FeS assembly protein SufB  64.8 
 
 
471 aa  627  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0566441  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0863  FeS assembly protein SufB  61.22 
 
 
465 aa  621  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.15258  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0847  FeS assembly protein SufB  61.22 
 
 
465 aa  621  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0308  FeS assembly protein SufB  64.86 
 
 
471 aa  623  1e-177  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0830737 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0956  FeS assembly protein SufB  63.1 
 
 
471 aa  623  1e-177  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.983445  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1006  FeS assembly protein SufB  61.71 
 
 
468 aa  618  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.570734 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0543  FeS assembly protein SufB  62.8 
 
 
466 aa  617  1e-175  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0500  FeS assembly protein SufB  61 
 
 
465 aa  617  1e-175  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.657519  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0145  hypothetical protein  60.25 
 
 
472 aa  617  1e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.110182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0784  FeS assembly protein SufB  60.39 
 
 
469 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116818  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0222  hypothetical protein  59.91 
 
 
472 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1969  hypothetical protein  59.21 
 
 
470 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0895  FeS assembly protein SufB  57.46 
 
 
469 aa  562  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00169372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2331  FeS assembly protein SufB  54.06 
 
 
467 aa  543  1e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.291789  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2034  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  57.14 
 
 
476 aa  543  1e-153  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0266  FeS assembly protein SufB  55.2 
 
 
470 aa  533  1e-150  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0582539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4169  FeS assembly protein SufB  53.42 
 
 
486 aa  530  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.274482  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0377  FeS assembly protein SufB  56.79 
 
 
475 aa  530  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.358098  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1111  Fe-S cluster assembly ABC-type transport system, permease component  57.18 
 
 
462 aa  527  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3231  FeS assembly protein SufB  55.02 
 
 
475 aa  515  1.0000000000000001e-145  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0667  FeS assembly protein SufB  52.53 
 
 
488 aa  513  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0175  FeS assembly protein SufB  56.15 
 
 
476 aa  514  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2431  FeS assembly protein SufB  53.8 
 
 
476 aa  512  1e-144  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2919  FeS assembly protein SufB  54.34 
 
 
476 aa  509  1e-143  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1501  FeS assembly protein SufB  55.03 
 
 
476 aa  508  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1141  FeS assembly protein SufB  53.17 
 
 
471 aa  507  9.999999999999999e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0488  FeS assembly protein SufB  51.3 
 
 
478 aa  501  1e-141  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.8001  normal  0.461804 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1460  FeS assembly protein SufB  49.56 
 
 
464 aa  499  1e-140  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1414  FeS assembly protein SufB  49.34 
 
 
464 aa  499  1e-140  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1639  FeS assembly protein SufB  50.99 
 
 
470 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.280246  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0655  FeS assembly protein SufB  52.16 
 
 
471 aa  493  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4735  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0050  FeS assembly protein SufB  51.03 
 
 
463 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.280227  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2271  FeS assembly protein SufB  49.12 
 
 
471 aa  484  1e-135  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26790  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  49.55 
 
 
469 aa  478  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1260  FeS assembly protein SufB  48.97 
 
 
469 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000785433  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0401  FeS assembly protein SufB  46.62 
 
 
472 aa  463  1e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00776839  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12910  Iron-regulated ABC transporter membrane component SufB  47.27 
 
 
472 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1657  FeS assembly protein SufB  46 
 
 
483 aa  436  1e-121  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1906  FeS assembly protein SufB  46.22 
 
 
479 aa  434  1e-120  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11489  hypothetical protein  79.45 
 
 
846 aa  419  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000249036  normal  0.700584 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4729  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  42.43 
 
 
480 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0424  cysteine desulfurase activator complex subunit SufB  42.22 
 
 
479 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746607  normal  0.0638657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>