More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0599 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0599  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 338 aa  696    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0298214  normal  0.491276 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  40.86 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  41.2 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  41.2 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  41.2 
 
 		 303 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  41.2 
 
 		 303 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  40.86 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  40.86 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  39.87 
 
 		 303 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  39.87 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  39.2 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  42.33 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  42.86 
 
 		 303 aa  226  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  40.94 
 
 		 306 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  40.47 
 
 		 302 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13290  1-phosphofructokinase  39.62 
 
 		 318 aa  220  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  40.6 
 
 		 306 aa  219  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  41.23 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  40.49 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  40.62 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  38.05 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  38.05 
 
 		 306 aa  207  3e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  39.24 
 
 		 303 aa  201  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  41.2 
 
 		 303 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  35.81 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3759  1-phosphofructokinase  40.07 
 
 		 304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  40 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  37.58 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  37.72 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0109  1-phosphofructokinase  37.67 
 
 		 302 aa  182  7e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  33.11 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  35.96 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  35.29 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  34.23 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  34.71 
 
 		 324 aa  156  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0852  1-phosphofructokinase, putative  32.56 
 
 		 311 aa  155  1e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.810869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  31.73 
 
 		 310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl180  1-phosphofructokinase  35.36 
 
 		 311 aa  152  1e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0148  fructose-1-phosphate kinase-like protein  33.71 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000234171 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  32.18 
 
 		 307 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0619  1-phosphofructokinase  31.44 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.502151  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  32.48 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  31.14 
 
 		 307 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1965  1-phosphofructokinase  30.46 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.261569  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  31 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  30.7 
 
 		 315 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  32.43 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  34.17 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  31.46 
 
 		 309 aa  136  4e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4399  1-phosphofructokinase  30.03 
 
 		 315 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  33.78 
 
 		 318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12200  1-phosphofructokinase  30 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  35.42 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1482  1-phosphofructokinase  35.42 
 
 		 319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.132343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  27.84 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  28.39 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  30.19 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0650  1-phosphofructokinase  32.57 
 
 		 303 aa  127  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.934038  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0322  1-phosphofructokinase  27.18 
 
 		 305 aa  125  8.000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000799963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  32.88 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0091  1-phosphofructokinase  29.93 
 
 		 325 aa  125  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.720236  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0824  1-phosphofructokinase  31.33 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  31.15 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  30.59 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1103  1-phosphofructokinase  34.07 
 
 		 303 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  30 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18260  1-phosphofructokinase  31.67 
 
 		 314 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00550374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  30.84 
 
 		 311 aa  123  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2661  1-phosphofructokinase  34.03 
 
 		 302 aa  122  7e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1584  1-phosphofructokinase  31.32 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  30.06 
 
 		 311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1735  1-phosphofructokinase  32.3 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2760  1-phosphofructokinase  34.48 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  28.07 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  32.31 
 
 		 310 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0450  1-phosphofructokinase  28.77 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  32.71 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  31.56 
 
 		 315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1060  1-phosphofructokinase  35.74 
 
 		 308 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  31.16 
 
 		 310 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2862  1-phosphofructokinase protein  32.1 
 
 		 316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.558464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  32.79 
 
 		 320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2425  1-phosphofructokinase  33.09 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  33.09 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  32.1 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  30.1 
 
 		 310 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2744  1-phosphofructokinase  31.48 
 
 		 318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.656221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2328  1-phosphofructokinase  32.71 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3552  1-phosphofructokinase  29.22 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05959  1-phosphofructokinase  27.93 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3109  1-phosphofructokinase  32.12 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  27.34 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1925  1-phosphofructokinase  32.34 
 
 		 312 aa  112  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0601047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3229  1-phosphofructokinase  33.58 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000483919 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  26.82 
 
 		 311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0955  1-phosphofructokinase  29.33 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1188  1-phosphofructokinase  33.83 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.95293  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1653  1-phosphofructokinase  32.34 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000747305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>