More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0426 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0426  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 253 aa  527  1e-149  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06510  phosphoglyceromutase  73.71 
 
 		 253 aa  395  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.609997  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1697  phosphoglyceromutase  68.02 
 
 		 247 aa  367  1e-101  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2651  phosphoglycerate mutase 1 family protein  61.38 
 
 		 249 aa  324  7e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1424  phosphoglycerate mutase 1 family  57.96 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0896608  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1121  phosphoglyceromutase  58.44 
 
 		 251 aa  302  3.0000000000000004e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  56.73 
 
 		 248 aa  296  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0780  phosphoglyceromutase  53.66 
 
 		 249 aa  291  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0678  phosphoglyceromutase  55.1 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.90978  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  58.37 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  58.37 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 		 250 aa  286  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  58.37 
 
 		 250 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2111  phosphoglycerate mutase 1 family  55.1 
 
 		 248 aa  285  4e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.326311  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0187  phosphoglyceromutase  52.85 
 
 		 247 aa  282  5.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00937723  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  57.55 
 
 		 250 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  57.55 
 
 		 250 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  57.55 
 
 		 250 aa  281  8.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  57.55 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0667  phosphoglyceromutase  56.85 
 
 		 251 aa  280  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000997316  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  57.55 
 
 		 250 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2828  phosphoglyceromutase  56.28 
 
 		 247 aa  279  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2324  phosphoglycerate mutase 1 family protein  53.06 
 
 		 248 aa  279  2e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2895  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 250 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1411  phosphoglyceromutase  56.83 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3208  phosphoglyceromutase  56.83 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0662  phosphoglyceromutase  56.83 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0886  phosphoglycerate mutase  55.33 
 
 		 293 aa  279  3e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.344747 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0497  phosphoglyceromutase  56.83 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2838  phosphoglyceromutase  56.83 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0478  phosphoglyceromutase  56.83 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 250 aa  279  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0181  phosphoglyceromutase  56.83 
 
 		 249 aa  279  3e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  56.33 
 
 		 250 aa  279  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3514  phosphoglycerate mutase 1 family protein  55.33 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0019746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3858  phosphoglyceromutase  55.06 
 
 		 247 aa  278  6e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.744697  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0353  phosphoglyceromutase  54.84 
 
 		 267 aa  277  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.136198 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0446  phosphoglyceromutase  56.56 
 
 		 270 aa  277  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1072  phosphoglyceromutase  53.47 
 
 		 249 aa  276  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.095004  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0416  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.886094  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1309  phosphoglyceromutase  54.51 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  57.14 
 
 		 250 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3505  phosphoglyceromutase  57.83 
 
 		 247 aa  276  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.991193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0627  phosphoglyceromutase  51.63 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  55.92 
 
 		 250 aa  276  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0671  phosphoglycerate mutase 1 family  52.03 
 
 		 247 aa  275  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2912  phosphoglyceromutase  56.56 
 
 		 248 aa  275  4e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  55.92 
 
 		 250 aa  275  6e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00439  phosphoglyceromutase  54.69 
 
 		 248 aa  275  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1938  phosphoglyceromutase  51.63 
 
 		 247 aa  275  6e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.90026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  55.51 
 
 		 250 aa  275  7e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0251  phosphoglycerate mutase  55.1 
 
 		 436 aa  274  9e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2868  phosphoglyceromutase  56.15 
 
 		 248 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2774  phosphoglyceromutase  56.15 
 
 		 248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2243  phosphoglyceromutase  56.15 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.545502  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2857  phosphoglyceromutase  56.15 
 
 		 270 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310958  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6186  phosphoglyceromutase  56.15 
 
 		 270 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4181  phosphoglyceromutase  54.51 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0534  phosphoglyceromutase  54.51 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0953  phosphoglyceromutase  52.65 
 
 		 249 aa  272  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.197373  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0304  phosphoglyceromutase  54.29 
 
 		 248 aa  271  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1813  phosphoglyceromutase  55.07 
 
 		 247 aa  272  5.000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1653  phosphoglyceromutase  53.91 
 
 		 247 aa  270  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00239487  normal  0.883975 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0611  phosphoglycerate mutase 1 family  54.59 
 
 		 247 aa  269  2.9999999999999997e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4103  phosphoglycerate mutase 1 family  54.25 
 
 		 247 aa  268  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0228  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314651 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0209  phosphoglyceromutase  53.23 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0780605 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0601  phosphoglycerate mutase 1 family  54.15 
 
 		 229 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0130  phosphoglyceromutase  50.41 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00296259 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0266  phosphoglyceromutase  53.69 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  54.29 
 
 		 249 aa  267  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1059  phosphoglycerate mutase 1 family  56.7 
 
 		 229 aa  266  2e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1450  phosphoglyceromutase  52.24 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0421206  normal  0.072339 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  49.39 
 
 		 248 aa  266  2.9999999999999995e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3004  phosphoglycerate mutase  54.1 
 
 		 253 aa  265  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0298836  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0772  phosphoglycerate mutase 1 family  50.61 
 
 		 601 aa  265  7e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1612  phosphoglyceromutase  52.26 
 
 		 247 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04761  phosphoglyceromutase  53.06 
 
 		 249 aa  263  1e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.151884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  53.71 
 
 		 247 aa  263  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0927  phosphoglycerate mutase 1 family protein  52.42 
 
 		 250 aa  260  2e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.224068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3501  phosphoglycerate mutase 1 family  53.95 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0405653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0713  phosphoglycerate mutase  54.19 
 
 		 247 aa  258  6e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1653  phosphoglyceromutase  53.54 
 
 		 229 aa  258  8e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1948  phosphoglyceromutase  52.21 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3570  phosphoglycerate mutase 1 family  53.51 
 
 		 234 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0635  phosphoglyceromutase  52.24 
 
 		 249 aa  256  3e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00161854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_51298  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0036  phosphoglycerate mutase 1 family protein  54.39 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  0.827774 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4338  phosphoglycerate mutase 1 family  53.88 
 
 		 248 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0251  phosphoglycerate mutase  50.88 
 
 		 237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3133  phosphoglyceromutase  54.19 
 
 		 228 aa  251  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121125  normal  0.825822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3765  phosphoglycerate mutase  50.44 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1052  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0445459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>