More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0290 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
631 aa  1272  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  3.72175e-06  normal  0.539461 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13740  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  53.26 
 
 
638 aa  634  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1544  heavy metal translocating P-type ATPase  52.88 
 
 
640 aa  622  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0567508  normal  0.0780509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0433  heavy metal translocating P-type ATPase  50.24 
 
 
786 aa  620  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2557  cadmium-translocating P-type ATPase  51.1 
 
 
629 aa  612  1e-174  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00040081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05940  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  52.25 
 
 
638 aa  602  1e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.558589 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1065  hypothetical protein  48.73 
 
 
626 aa  596  1e-169  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.770799  normal  0.783776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1276  heavy metal translocating P-type ATPase  50 
 
 
786 aa  593  1e-168  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0121  heavy metal translocating P-type ATPase  49.36 
 
 
616 aa  594  1e-168  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  3.85765e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0234  cadmium-translocating P-type ATPase  49.36 
 
 
618 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00321637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0652  heavy metal-transporting ATPase  50 
 
 
788 aa  590  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.29605e-07 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4704  heavy metal-transporting ATPase  49.83 
 
 
788 aa  591  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0990671 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0506  cation-transporting ATPase, P-type  50 
 
 
788 aa  589  1e-167  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.907696  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0634  heavy metal-transporting ATPase  50 
 
 
788 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373732  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0508  cation-transporting ATPase, P-type  50 
 
 
788 aa  590  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0595  heavy metal-transporting ATPase  50.51 
 
 
788 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0510  cadmium-translocating P-type ATPase  49.44 
 
 
784 aa  581  1e-164  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0564  heavy metal-transporting ATPase  50.51 
 
 
788 aa  578  1e-164  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0512  heavy metal translocating P-type ATPase  49.49 
 
 
785 aa  577  1e-163  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0723  heavy metal-transporting ATPase  50.34 
 
 
788 aa  578  1e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0244  heavy metal translocating P-type ATPase  49.76 
 
 
707 aa  576  1e-163  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.787519  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0663  heavy metal-transporting ATPase  50.34 
 
 
788 aa  578  1e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1162  heavy metal translocating P-type ATPase  46.97 
 
 
658 aa  563  1e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  46.66 
 
 
682 aa  556  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0770  heavy metal translocating P-type ATPase  47 
 
 
699 aa  555  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2203  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  47.79 
 
 
700 aa  554  1e-156  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.588592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0927  heavy metal translocating P-type ATPase  46.74 
 
 
800 aa  545  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.28162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2587  cadmium-translocating P-type ATPase  45.63 
 
 
738 aa  541  1e-152  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0336  heavy metal translocating P-type ATPase  45.53 
 
 
690 aa  533  1e-150  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2289  zinc-transporting atpase  45.79 
 
 
738 aa  529  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.362912  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20930  heavy metal translocating P-type ATPase  46.14 
 
 
745 aa  524  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.62182e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11668  cation-transporting ATPase, P-type, putative zinc-transporting ATPase  44.82 
 
 
654 aa  515  1e-144  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.292435  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1510  cation-transporting ATPase; zinc-transporting ATPase  45.17 
 
 
664 aa  505  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00216994  normal  0.157435 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1064  cation-transporting ATPase  44.35 
 
 
667 aa  503  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.632696  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0421  heavy metal translocating P-type ATPase  46.57 
 
 
721 aa  501  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.403796  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1742  cadmium-translocating P-type ATPase  45.23 
 
 
773 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.106711  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  41.88 
 
 
696 aa  494  1e-138  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2686  heavy metal translocating P-type ATPase  42.5 
 
 
656 aa  492  1e-138  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682129  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2261  heavy metal translocating P-type ATPase  43.81 
 
 
658 aa  489  1e-137  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1966  heavy metal translocating P-type ATPase  43.48 
 
 
682 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2462  heavy metal translocating P-type ATPase  42.1 
 
 
724 aa  476  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3344  heavy metal translocating P-type ATPase  42.66 
 
 
663 aa  472  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.601445  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1384  cadmium-translocating P-type ATPase  42.79 
 
 
643 aa  471  1e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6787  heavy metal translocating P-type ATPase  42.1 
 
 
671 aa  469  1e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.423495  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6746  heavy metal translocating P-type ATPase  41.58 
 
 
670 aa  469  1e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1265  heavy metal translocating P-type ATPase  42.5 
 
 
696 aa  466  1e-130  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.247851  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1187  heavy metal translocating P-type ATPase  39.84 
 
 
671 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491713 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0552  cadmium-translocating P-type ATPase  40.57 
 
 
645 aa  447  1e-124  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  39.83 
 
 
641 aa  430  1e-119  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  1.23465e-05  hitchhiker  1.22053e-07 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  36.56 
 
 
712 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  36.56 
 
 
712 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  36.41 
 
 
712 aa  416  1e-115  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1690  heavy metal translocating P-type ATPase  36.82 
 
 
767 aa  412  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1517  heavy metal translocating P-type ATPase  38.87 
 
 
624 aa  407  1e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0910099  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  37.2 
 
 
695 aa  400  1e-110  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.040905  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1410  heavy metal translocating P-type ATPase  37.19 
 
 
613 aa  400  1e-110  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  39.86 
 
 
783 aa  400  1e-110  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 
713 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  35.64 
 
 
833 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  36.24 
 
 
707 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.23 
 
 
709 aa  384  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  38.02 
 
 
752 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  38.37 
 
 
701 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  38.65 
 
 
750 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3233  heavy metal translocating P-type ATPase  38 
 
 
785 aa  375  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.27574  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1125  Cd/Co/Hg/Pb/Zn-translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
751 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.228678  normal  0.104561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  38.86 
 
 
750 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  37.87 
 
 
750 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  38.69 
 
 
750 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
800 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  37.64 
 
 
800 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0921  heavy metal translocating P-type ATPase  36.32 
 
 
844 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  37.64 
 
 
800 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
800 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0479  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
939 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  37.27 
 
 
799 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
984 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
984 aa  372  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  36.92 
 
 
791 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  39.51 
 
 
712 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2018  cadmium-translocating P-type ATPase  36.62 
 
 
814 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  37.48 
 
 
800 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4439  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  36.72 
 
 
709 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4594  ZntA, P-type ATPase involved in Zn(II), Cd(II), Tl(I) and Pb(II) resistance  38.18 
 
 
794 aa  372  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0280589  hitchhiker  0.0082213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  36.54 
 
 
673 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2698  heavy metal translocating P-type ATPase  35.56 
 
 
734 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.810739 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.85 
 
 
739 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  36.8 
 
 
769 aa  369  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0212  heavy metal translocating P-type ATPase  36.08 
 
 
758 aa  368  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  37.25 
 
 
866 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1347  heavy metal translocating P-type ATPase  35.49 
 
 
738 aa  368  1e-100  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.174649 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4212  heavy metal translocating P-type ATPase  37 
 
 
1022 aa  368  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2849  heavy metal translocating P-type ATPase  38.72 
 
 
734 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1942  cadmium-translocating P-type ATPase  36.46 
 
 
704 aa  365  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0854  heavy metal translocating P-type ATPase  37.6 
 
 
812 aa  364  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  36.35 
 
 
734 aa  365  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4837  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  37.69 
 
 
752 aa  363  5e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  37.87 
 
 
848 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3295  heavy metal translocating P-type ATPase  36.5 
 
 
639 aa  363  6e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.853609  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2450  heavy metal translocating P-type ATPase  36.98 
 
 
738 aa  362  8e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0805426  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>