50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5190 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5190  OpcA protein  100 
 
 		 379 aa  737    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.800269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15940  opcA protein  68.45 
 
 		 338 aa  455  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.948497  normal  0.907148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2925  OpcA protein  64.98 
 
 		 406 aa  374  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2258  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  55.97 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000384596  normal  0.178888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2525  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  58.96 
 
 		 305 aa  355  5e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.588015  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1834  oxppcycle protein  62.46 
 
 		 313 aa  333  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000163102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19970  glucose-6-P dehydrogenase subunit  56.9 
 
 		 306 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1554  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  56.71 
 
 		 313 aa  322  5e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2371  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  54.79 
 
 		 304 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.534818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3695  OpcA protein  55.26 
 
 		 302 aa  319  5e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.487915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2093  oxppcycle protein  60.75 
 
 		 313 aa  316  4e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782007  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2451  OpcA protein  53.77 
 
 		 303 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.625854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2457  OpcA protein  53.77 
 
 		 303 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.574411  normal  0.7634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2411  opcA protein  53.77 
 
 		 303 aa  310  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.870289  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1937  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  53.27 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.10889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11474  oxpP cycle protein opcA  53.44 
 
 		 303 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2164  putative OpcA protein  51.79 
 
 		 310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.161669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1261  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  50.67 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0955551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2717  OpcA protein  55.41 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.35023  normal  0.27642 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13170  glucose-6-P dehydrogenase subunit  47.27 
 
 		 338 aa  288  8e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.522993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2209  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  51.59 
 
 		 319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000267002  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2977  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  50 
 
 		 308 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11390  opcA protein  54.03 
 
 		 313 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2243  hypothetical protein  47.68 
 
 		 376 aa  267  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1984  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  49.67 
 
 		 302 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23332  normal  0.569103 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0184  putative OpcA protein  45.28 
 
 		 313 aa  263  4e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2006  hypothetical protein  48.87 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1242  glucose-6-phosphate dehydrogenase assembly protein OpcA  43.16 
 
 		 341 aa  258  9e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6017  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  49.34 
 
 		 303 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.660052 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1123  oxppcycle protein  45.57 
 
 		 314 aa  251  1e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0116933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15240  6-phosphogluconolactonase  44.37 
 
 		 571 aa  240  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.031101  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2537  oxppcycle protein  45.07 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3320  hypothetical protein  43.29 
 
 		 337 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.738896  hitchhiker  0.00154005 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3093  hypothetical protein  41.72 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.123157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2072  putative OxPP cycle protein OpcA  42.72 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.833679  normal  0.0837693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1646  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  40.57 
 
 		 370 aa  187  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.412034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2418  Glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  39.09 
 
 		 318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2054  Glucose-6-phosphate dehydrogenase subunit  41.53 
 
 		 373 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3191  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  26.67 
 
 		 378 aa  66.6  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.498167 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0052  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.94 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09391  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  27.67 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0898782 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11151  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  34.46 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.250684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1919  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  33.1 
 
 		 428 aa  56.2  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.619601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0747  glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  29.31 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.702219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3022  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like  26.13 
 
 		 370 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2561  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.15 
 
 		 377 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1851  glucose-6-P dehydrogenase subunit-like protein  29.19 
 
 		 373 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.26277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3426  OpcA protein  22.96 
 
 		 456 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15111  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  26.74 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0677  putative glucose 6-phosphate dehydrogenase effector OpcA  25.42 
 
 		 435 aa  43.5  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>