262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1923 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1956  50S ribosomal protein L36  100 
 
 
38 aa  75.5  2e-13  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1923  50S ribosomal protein L36  100 
 
 
38 aa  75.5  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1934  50S ribosomal protein L36  100 
 
 
38 aa  75.5  2e-13  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.549268 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2041  50S ribosomal protein L36  100 
 
 
38 aa  75.5  2e-13  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.89804  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0508  ribosomal protein L36  73.68 
 
 
55 aa  61.2  5e-09  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.130854  hitchhiker  0.00874206 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17201  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  61.2  5e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4728  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243342  normal  0.440571 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0647  ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3888  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159643  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0475  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  60.8  6e-09  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  2.19186e-05 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00959  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  60.5  9e-09  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  2.39291e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0426  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.7  1e-08  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.128717  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1946  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
46 aa  59.7  1e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.779159  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2378  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.7  1e-08  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000145037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09070  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.417954 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0858  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.7  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3724  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
46 aa  59.7  1e-08  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0547196  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3500  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
46 aa  59.7  1e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1010  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  6.78722e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2737  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.88036  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0505  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000136096  normal  0.026153 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0304  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  2.29696e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2928  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  2.01149e-05 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0336  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.191743  hitchhiker  0.00985215 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2817  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111902  normal  0.172342 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0298  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00439653  normal  0.106289 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0980  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  1.94486e-08  hitchhiker  0.00368678 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3046  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.13587  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0349  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0968367 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0271  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0386198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3469  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal  0.403027 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3782  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3730  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00190831  hitchhiker  0.00407202 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2997  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.373572 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3980  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.208556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0344  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  58.9  2e-08  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0208995  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2610  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3801  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0207121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0370  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0917084  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3147  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0831779  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0289  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3754  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0869692  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3622  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00017542  hitchhiker  1.19611e-10 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3275  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  59.3  2e-08  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000772406 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1763  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  58.5  3e-08  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03101  hypothetical protein  68.42 
 
 
38 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0561863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1250  50S ribosomal protein L36P  78.95 
 
 
41 aa  58.5  3e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000204955  normal  0.169587 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3782  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  5.25761e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1754  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  58.5  3e-08  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3493  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.32904e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06460  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  58.5  3e-08  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4622  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  9.00319e-06  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0788  50S ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  58.2  3e-08  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  2.98686e-07  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0414  ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.3684e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03150  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0836067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0649  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  58.5  3e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.141795  hitchhiker  4.01292e-06 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0510  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
38 aa  58.5  3e-08  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.106687  hitchhiker  0.00286829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1369  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  58.5  3e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0029921  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0091  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  58.5  3e-08  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0580273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3594  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0054931  normal  0.0468357 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0414  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  58.5  3e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.52081e-05  unclonable  1.17832e-08 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1884  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  58.2  4e-08  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  3.86083e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3158  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  58.2  4e-08  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3295  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  58.2  4e-08  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0081  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  58.2  4e-08  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  2.65715e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3983  ribosomal protein L36  81.58 
 
 
37 aa  57.8  5e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0499215  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0617  50S ribosomal protein L36P  71.05 
 
 
39 aa  57.8  6e-08  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  4.6769e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01410  ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  57.4  7e-08  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.50249e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1946  ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  57.4  7e-08  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3643  ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  57.4  7e-08  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.84767e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1460  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
39 aa  57.4  7e-08  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  2.82576e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1551  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57.4  7e-08  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0682  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  57  8e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2212  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  57  8e-08  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1313  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  56.2  1e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0512712  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl147  50S ribosomal protein L36  78.95 
 
 
37 aa  56.6  1e-07  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.31262e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1743  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  56.2  1e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0919945  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2235  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  56.6  1e-07  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00944061  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0740  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  56.2  1e-07  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00337234  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0868  50S ribosomal protein L36P  76.32 
 
 
37 aa  55.8  2e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  8.07899e-11  hitchhiker  0.00596219 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1159  ribosomal protein L36  68.42 
 
 
41 aa  55.8  2e-07  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  1.29575e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2580  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  55.8  2e-07  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129778  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0356  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  56.2  2e-07  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0739  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  55.8  2e-07  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1137  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  55.8  2e-07  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  9.48568e-05  normal  0.0431447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2991  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  55.5  2e-07  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16581  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.5  2e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.731306  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3001  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
38 aa  55.5  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.353822  hitchhiker  0.00596696 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1975  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  55.5  2e-07  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.341168  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03080  50s ribosomal protein l36, putative  63.16 
 
 
107 aa  56.2  2e-07  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0218  50S ribosomal protein L36P  71.05 
 
 
39 aa  55.8  2e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.208607  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0313  50S ribosomal protein L36  68.42 
 
 
38 aa  55.8  2e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00358606  unclonable  6.93478e-29 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1721  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  55.8  2e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  5.18993e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0724  ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  55.8  2e-07  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0249  50S ribosomal protein L36  73.68 
 
 
37 aa  55.8  2e-07  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2153  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  55.1  3e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  2.25133e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0231  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  55.5  3e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0228  50S ribosomal protein L36  71.05 
 
 
37 aa  55.5  3e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000229523  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00751  50S ribosomal protein L36  76.32 
 
 
37 aa  55.1  3e-07  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001721  LSU ribosomal protein L36p  76.32 
 
 
37 aa  55.1  3e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  3.73745e-09  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>