45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0012 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0012  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  145  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000301607  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0002  tRNA-Ala  98.63 
 
 
76 bp  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0002  tRNA-Ala  98.63 
 
 
76 bp  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0043  tRNA-Ala  97.26 
 
 
73 bp  129  9e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.734011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0008  tRNA-Ala  95.89 
 
 
73 bp  121  2e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0013  tRNA-Val  98.36 
 
 
69 bp  113  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160269  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309286  tRNA-Ala  94.52 
 
 
73 bp  113  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0043  tRNA-Ala  91.78 
 
 
73 bp  97.6  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0040  tRNA-Ala  96.3 
 
 
76 bp  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0031  tRNA-Ala  90.41 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0170329  normal  0.236609 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0877    93.48 
 
 
294 bp  67.9  3e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1441  tRNA-Ala  88.89 
 
 
73 bp  60  7e-08  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  1.9523e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Ala-3  tRNA-Ala  88.89 
 
 
76 bp  60  7e-08  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.05432  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0053  tRNA-Ala  87.93 
 
 
73 bp  60  7e-08  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.00525e-07 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0055  tRNA-Ala  88.89 
 
 
76 bp  60  7e-08  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0011  tRNA-Ala  89.8 
 
 
76 bp  58  3e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0038  tRNA-Ala  89.8 
 
 
76 bp  58  3e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59206  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0048  tRNA-Ala  89.8 
 
 
73 bp  58  3e-07  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0046  tRNA-Ala  89.8 
 
 
76 bp  58  3e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.137197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0010  tRNA-Ala  89.8 
 
 
76 bp  58  3e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0964882  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0057  tRNA-Ala  89.8 
 
 
76 bp  58  3e-07  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0068  tRNA-Ala  87.76 
 
 
76 bp  50.1  7e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.781599  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0023  tRNA-Ala  90.24 
 
 
76 bp  50.1  7e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.592453  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0027  tRNA-Ala  87.76 
 
 
76 bp  50.1  7e-05  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.987879  normal  0.104292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0044  tRNA-Ala  87.76 
 
 
73 bp  50.1  7e-05  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t27  tRNA-Pro  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0120151  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Ala-2  tRNA-Ala  100 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  5.8592e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0003  tRNA-Ala  85 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0411773  normal  0.562233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0002  tRNA-Ala  85 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353187  normal  0.0609648 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0007  tRNA-Ala  86.54 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.110552  normal  0.490785 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0002  tRNA-Ala  85 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.534142 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0002  tRNA-Ala  85 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.22367  normal  0.0175054 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0002  tRNA-Ala  85 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0028  tRNA-Pro  89.74 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.988711  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1816  tRNA-Ala  85.45 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0030  tRNA-Pro  89.74 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0032  tRNA-Pro  89.74 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0312905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0057  tRNA-Ala  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0030  tRNA-Ala  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546773  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0034  tRNA-Ala  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0031  tRNA-Ala  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0039  tRNA-Ala  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0063  tRNA-Ala  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0034  tRNA-Ala  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.884899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0011  tRNA-Ala  85.19 
 
 
76 bp  44.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0613646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>