11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_0877 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_0877    100 
 
 
294 bp  583  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0043  tRNA-Ala  97.83 
 
 
73 bp  83.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.734011 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0008  tRNA-Ala  93.48 
 
 
73 bp  67.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0012  tRNA-Ala  93.48 
 
 
73 bp  67.9  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000301607  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAAlaVIMSS1309286  tRNA-Ala  93.02 
 
 
73 bp  61.9  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0564631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0002  tRNA-Ala  91.49 
 
 
76 bp  61.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0002  tRNA-Ala  91.49 
 
 
76 bp  61.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0043  tRNA-Ala  91.3 
 
 
73 bp  60  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0013  tRNA-Val  91.3 
 
 
69 bp  60  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.160269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0031  tRNA-Ala  91.11 
 
 
73 bp  58  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0170329  normal  0.236609 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0040  tRNA-Ala  96.77 
 
 
76 bp  54  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>