23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4132 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  310  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  96.1 
 
 		 154 aa  299  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  41.79 
 
 		 142 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  39.01 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  39.42 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  37.69 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  33.58 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  33.58 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  36.69 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  39.37 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  38.58 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  45.61 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0097  hypothetical protein  34.53 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.326902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1561  hypothetical protein  33.09 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  33.08 
 
 		 233 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  28.76 
 
 		 201 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  30.34 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  28.12 
 
 		 211 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3768  hypothetical protein  33.85 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  29.84 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1286  hypothetical protein  32.09 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2114  hypothetical protein  32.09 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>