22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A0663 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  100 
 
 		 192 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  100 
 
 		 192 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  54.24 
 
 		 177 aa  204  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  37.57 
 
 		 201 aa  122  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  35.96 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  34.92 
 
 		 211 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  37.5 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  33.58 
 
 		 154 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  30.15 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  28.99 
 
 		 145 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  32.09 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  30.43 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  30.07 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  32.62 
 
 		 158 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  28.97 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  30.23 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  27.78 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0720  protein of unknown function DUF1018  38.24 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.915248 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2114  hypothetical protein  25.9 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1286  hypothetical protein  25.9 
 
 		 145 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  33.8 
 
 		 133 aa  45.1  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2590  hypothetical protein  39.62 
 
 		 100 aa  43.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5255  normal  0.136566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>