16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3375 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  43.67 
 
 		 202 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  40.18 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  37.33 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  34.81 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  35.34 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  31.16 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  27.78 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  27.78 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  32.28 
 
 		 142 aa  52.4  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  32.19 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  33.08 
 
 		 154 aa  48.5  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  26.32 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  24.83 
 
 		 206 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>