18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4512 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  34.45 
 
 
233 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  35.05 
 
 
202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  41.73 
 
 
215 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  42.45 
 
 
217 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  38.19 
 
 
177 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  34.97 
 
 
145 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  33.09 
 
 
144 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  32 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  32 
 
 
192 aa  64.3  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  32.37 
 
 
158 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  32.86 
 
 
142 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  34.29 
 
 
154 aa  50.1  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  34.29 
 
 
154 aa  49.3  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2946  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  48.5  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  25.68 
 
 
211 aa  46.6  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  27.4 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  26 
 
 
201 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>