19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0202 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0720  protein of unknown function DUF1018  44.44 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.915248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3768  hypothetical protein  33.85 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2590  hypothetical protein  35.35 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.5255  normal  0.136566 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2946  hypothetical protein  30.71 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1653  bacteriophage protein  34.11 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  45.76 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  45.61 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  25.56 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  35.38 
 
 		 215 aa  49.3  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  33.8 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  33.8 
 
 		 192 aa  45.1  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1561  hypothetical protein  30.53 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  44.7  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2114  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.848091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1286  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  26.47 
 
 		 145 aa  43.9  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  33.77 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  32.18 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>