13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1561 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1561  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0097  hypothetical protein  43.18 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.326902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3768  hypothetical protein  36.08 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  28.68 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  32.37 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  39.02 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  32.84 
 
 		 215 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  30.53 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1653  bacteriophage protein  37.97 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  29.01 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0258  hypothetical protein  28.03 
 
 		 149 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2386  hypothetical protein  27.22 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>