12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0097 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0097  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  279  1e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.326902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1561  hypothetical protein  43.18 
 
 
142 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  34.53 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  31.39 
 
 
154 aa  50.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  30.37 
 
 
177 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3768  hypothetical protein  33.07 
 
 
151 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2386  hypothetical protein  31.61 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1653  bacteriophage protein  41.38 
 
 
189 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  33.33 
 
 
215 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2946  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  26.67 
 
 
192 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  26.67 
 
 
192 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>