21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2921 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2921  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  308  1e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.182406 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4132  hypothetical protein  96.1 
 
 
154 aa  299  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148477 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0077  hypothetical protein  40.3 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000439598  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2728  hypothetical protein  39.72 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000950807  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2667  hypothetical protein  36.15 
 
 
177 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0425  protein of unknown function DUF1018  38.81 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.198831  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0663  protein gp16  32.09 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000162215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0774  protein gp16  32.09 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000715084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2284  putative phage regluatory protein  37.41 
 
 
158 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3025  hypothetical protein  38.58 
 
 
215 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3060  hypothetical protein  38.58 
 
 
217 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0202  hypothetical protein  45.76 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3375  protein of unknown function DUF1018  32.19 
 
 
233 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0097  hypothetical protein  31.39 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.326902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1561  hypothetical protein  32.37 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2076  hypothetical protein  28.57 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000389889  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4512  hypothetical protein  31.43 
 
 
225 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216446  normal  0.847002 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0651  hypothetical protein  28.05 
 
 
201 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2123  hypothetical protein  27.54 
 
 
211 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000011259  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3768  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.439257  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0658  Mu-like prophage protein GP16  29.84 
 
 
202 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>